RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432588.5

ACTB-205, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 4

Gene ACTB, Length 568 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-205ENST00000432588 STARD3NLO95772 234 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 TM4SF1P30408 202 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 NARFQ9UHQ1 456 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 CEP350Q5VT06 3117 aa21.73■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 KCNA3P22001 575 aa21.72■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 IL17REQ8NFR9 667 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 NUDCQ9Y266 331 aa21.71■■□□□ 1.07
ACTB-205ENST00000432588 CANXP27824 592 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 ZNF790Q6PG37 636 aa21.69■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 A0A087WZG4 1122 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 NFIXQ14938 502 aa21.68■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 HEG1Q9ULI3 1381 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 CHRNA5P30532 468 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 PRKAR2BP31323 418 aa21.67■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 FMNL2Q96PY5 1086 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 RSPH6AQ9H0K4 717 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa21.66■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 KIF3CO14782 793 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 HSPA6P17066 643 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 EIF5P55010 431 aaKnown RBP21.65■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 PHACTR3Q96KR7 559 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 BCL2L12Q9HB09 334 aa21.65■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa21.64■■□□□ 1.06
ACTB-205ENST00000432588 SERPINB2P05120 415 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 PPP2R1AP30153 589 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.64■■□□□ 1.053e-42■□□□□ 8.5
ACTB-205ENST00000432588 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.64■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 BTBD11A6QL63 1104 aa21.63■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.62■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.61■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 NRXN2Q9P2S2 1712 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 RNF181Q9P0P0 153 aa21.6■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 TOMM70O94826 608 aa21.59■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 H0YIN7 160 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 TTLL6Q8N841 843 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.58■■□□□ 1.05
ACTB-205ENST00000432588 KDM2BQ8NHM5 1336 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 A1BGP04217 495 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.57■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.56■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 KCNQ3O43525 872 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 NEFMP07197 916 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 MCM10Q7L590 875 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 SCN7AQ01118 1682 aa21.55■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 PDE6BP35913 854 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 SETDB2Q96T68 719 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 BRIP1Q9BX63 1249 aa21.54■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 NPHP1O15259 732 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.53■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 CAMTA2O94983 1202 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 APLP1P51693 650 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 USP16Q9Y5T5 823 aa21.52■■□□□ 1.04
ACTB-205ENST00000432588 LMNB1P20700 586 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 RASSF7Q02833 373 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 CNBD1Q8NA66 436 aa21.51■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 DCTN1Q14203 1278 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 ZNF652Q9Y2D9 606 aa21.5■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 ST5P78524 1137 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 SBF1O95248 1867 aa21.49■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 CLEC4GQ6UXB4 293 aa21.48■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 RRAGCQ9HB90 399 aa21.47■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 FSTL1Q12841 308 aa21.46■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
ACTB-205ENST00000432588 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 NFKBIEO00221 500 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 CNKSR1Q969H4 720 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 BCORQ6W2J9 1755 aa21.45■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 RGL2O15211 777 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 STYK1Q6J9G0 422 aa21.44■■□□□ 1.02
ACTB-205ENST00000432588 GLTPD2A6NH11 291 aa21.43■■□□□ 1.02
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