RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000423112.2

RFX3-AS1-201, RFX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene RFX3-AS1, Length 552 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CHADLQ6NUI6 762 aa22.84■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TIAM2Q8IVF5 1701 aa22.84■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 H0YIN7 160 aa22.83■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFKBIEO00221 500 aa22.83■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NFIXQ14938 502 aa22.83■■□□□ 1.25
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FOXN1O15353 648 aa22.82■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C2CD5Q86YS7 1000 aa22.82■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NARFQ9UHQ1 456 aa22.82■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TJP1Q07157 1748 aa22.82■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa22.81■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SERPINB2P05120 415 aa22.81■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AIDAQ96BJ3 306 aa22.81■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.8■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNTNAP1P78357 1384 aa22.79■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ERFEQ4G0M1 354 aa22.79■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa22.79■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.79■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.78■■□□□ 1.24
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL15A1P39059 1388 aa22.76■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa22.75■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IQCA1LA6NCM1 817 aa22.73■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LTBP3Q9NS15 1303 aa22.73■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 C21orf2O43822 256 aa22.72■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PDE6BP35913 854 aa22.72■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP22.72■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BCL2L12Q9HB09 334 aa22.72■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LDHDQ86WU2 507 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC52A2Q9HAB3 445 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PASKQ96RG2 1323 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.71■■□□□ 1.23
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TMEM88BA6NKF7 163 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DDNO94850 711 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEIP0CG38 1075 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POTEJP0CG39 1038 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VEGFBP49765 207 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 AEBP1Q8IUX7 1158 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WBP1LQ9NX94 342 aa22.7■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LBX1P52954 281 aa22.68■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SOGA3Q5TF21 947 aa22.68■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SULT6B1Q6IMI4 303 aa22.68■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.68■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.68■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 A0A087WZG4 1122 aa22.67■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 BICDL1Q6ZP65 573 aa22.67■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PCDH10Q9P2E7 1040 aa22.67■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN11AQ9UI33 1791 aa22.67■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FAM161AQ3B820 660 aa22.66■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ABHD8Q96I13 439 aa22.66■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP22.66■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa22.66■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNKSR1Q969H4 720 aa22.65■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CANXP27824 592 aaKnown RBP22.64■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SLC39A6Q13433 755 aa22.64■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MRC1P22897 1456 aa22.63■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STARD3NLO95772 234 aa22.63■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP22.63■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EIF5P55010 431 aaKnown RBP22.62■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.62■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.62■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.62■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 LGR6Q9HBX8 967 aa22.62■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RNMTO43148 476 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 DEFB115Q30KQ5 88 aa22.61■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 STYK1Q6J9G0 422 aa22.61■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SCN4AP35499 1836 aa22.61■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 RASSF10A6NK89 507 aa22.6■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 NPHP1O15259 732 aa22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 POLR3GLQ9BT43 218 aa22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CNBD1Q8NA66 436 aa22.58■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MASTLQ96GX5 879 aa22.58■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 HACL1Q9UJ83 578 aa22.58■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CLEC11AQ9Y240 323 aa22.58■■□□□ 1.21
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SRGNP10124 158 aa22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 IL13P35225 146 aa22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 ST5P78524 1137 aa22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 MORC1Q86VD1 984 aa22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 TTC5Q8N0Z6 440 aa22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.57■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.56■■□□□ 1.2
RFX3-AS1-201ENST00000423112 SETDB2Q96T68 719 aa22.56■■□□□ 1.2
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