RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421510.5

EHD1-204, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene EHD1, Length 1,015 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-204ENST00000421510 ADCY9O60503 1353 aa27.29■■□□□ 1.96
EHD1-204ENST00000421510 DPEP1P16444 411 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-204ENST00000421510 ZNF790Q6PG37 636 aa27.28■■□□□ 1.96
EHD1-204ENST00000421510 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP27.28■■□□□ 1.96
EHD1-204ENST00000421510 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
EHD1-204ENST00000421510 HEG1Q9ULI3 1381 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 C1QTNF8P60827 252 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 NARFQ9UHQ1 456 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 BCS1LQ9Y276 419 aa27.26■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 STARD3NLO95772 234 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 CANXP27824 592 aaKnown RBP27.25■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 TM4SF1P30408 202 aa27.25■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 FCHSD2O94868 740 aa27.24■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 KCNA3P22001 575 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 FMNL2Q96PY5 1086 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 BCL2L12Q9HB09 334 aa27.21■■□□□ 1.95
EHD1-204ENST00000421510 BTBD11A6QL63 1104 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 KCNQ3O43525 872 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 EIF5P55010 431 aaKnown RBP27.2■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 NFIXQ14938 502 aa27.2■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP27.2■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP27.19■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 MCM10Q7L590 875 aa27.18■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP27.18■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 A0A087WZG4 1122 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 CHRNA5P30532 468 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP27.17■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 PIM2Q9P1W9 311 aa27.17■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 NRXN2Q9P2S2 1712 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa27.16■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 SCN7AQ01118 1682 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa27.15■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP27.15■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 DCTN1Q14203 1278 aa27.14■■□□□ 1.94
EHD1-204ENST00000421510 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 A1BGP04217 495 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 SERPINB2P05120 415 aa27.13■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP27.13■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 BICDL1Q6ZP65 573 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa27.11■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 CARMIL3Q8ND23 1372 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 NEFMP07197 916 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 TBC1D9BQ66K14 1250 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 USP16Q9Y5T5 823 aa27.09■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa27.08■■□□□ 1.93
EHD1-204ENST00000421510 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 PLEKHF1Q96S99 279 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 DLEC1Q9Y238 1755 aa27.06■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 CAMTA2O94983 1202 aa27.05■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 BCORQ6W2J9 1755 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 DLG5Q8TDM6 1919 aa27.04■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 C9orf131Q5VYM1 1079 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP27.03■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.03■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 RALBP1Q15311 655 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 NFE2L2Q16236 605 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 MIS18AQ9NYP9 233 aa27.02■■□□□ 1.92
EHD1-204ENST00000421510 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 KIF3CO14782 793 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.01■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 KDM3BQ7LBC6 1761 aa26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 H0YIN7 160 aa26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 TTLL6Q8N841 843 aa26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 SETDB2Q96T68 719 aa26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.99■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 NBPF26B4DH59 902 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 NBPF15Q8N660 670 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 RNF181Q9P0P0 153 aa26.98■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.97■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 CNBD1Q8NA66 436 aa26.96■■□□□ 1.91
EHD1-204ENST00000421510 PDE6BP35913 854 aa26.95■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 RASSF7Q02833 373 aa26.95■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 CLEC4GQ6UXB4 293 aa26.94■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 NMRK2Q9NPI5 230 aa26.94■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.94■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.94■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 NPHP1O15259 732 aa26.93■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 SBF1O95248 1867 aa26.92■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.92■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 ST5P78524 1137 aa26.92■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 RGL2O15211 777 aa26.89■■□□□ 1.9
EHD1-204ENST00000421510 HSPA6P17066 643 aa26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms