RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420808.2

NISCH-202, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene NISCH, Length 2,589 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-202ENST00000420808 TEFQ10587 303 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 CLEC17AQ6ZS10 378 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 DNAAF4Q8WXU2 420 aa19.05■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP19.05■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 DTNBO60941 627 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 NCLP19338 710 aaKnown RBP19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 RHPN1Q8TCX5 695 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 LMBRD1Q9NUN5 540 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 POLA2Q14181 598 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 KDM3BQ7LBC6 1761 aa19.04■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 PI4K2BQ8TCG2 481 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 BABAM1Q9NWV8 329 aa19.03■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 ERBB4Q15303 1308 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 RNMTO43148 476 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 AKAP4Q5JQC9 854 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 ANKRD24Q8TF21 1146 aa19.02■□□□□ 0.64
NISCH-202ENST00000420808 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 NUCB2P80303 420 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 KLHL40Q2TBA0 621 aa19.01■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 GPT2Q8TD30 523 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 GOLGA6L22H0YM25 854 aa19■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 KCNH5Q8NCM2 988 aa18.99■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 SLC39A6Q13433 755 aa18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.98■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 SPG7Q9UQ90 795 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 CPA1P15085 419 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 C1orf141Q5JVX7 400 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 RGPD5Q99666 1765 aa18.97■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 RASEFQ8IZ41 740 aa18.96■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa18.96■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 KIF1BPQ96EK5 621 aa18.96■□□□□ 0.63
NISCH-202ENST00000420808 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 RAB11FIP3O75154 756 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 HOXB7P09629 217 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 KRT28Q7Z3Y7 464 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 KAZALD1Q96I82 304 aa18.94■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 SGSM2O43147 1006 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 MCCP23508 829 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 HSPA4P34932 840 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 CUL4AQ13619 759 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 GDPD2Q9HCC8 539 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 AOX1Q06278 1338 aa18.93■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PTMSP20962 102 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 SUCLG2Q96I99 432 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 SNX14Q9Y5W7 946 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 AMOTQ4VCS5 1084 aa18.92■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 BRD1O95696 1058 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 NASPP49321 788 aaPredicted RBP18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PDIA6Q15084 440 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 CABLES1Q8TDN4 633 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 RBSNQ9H1K0 784 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 MYL6BP14649 208 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 ANAPC15P60006 121 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 KSR2Q6VAB6 950 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 HEG1Q9ULI3 1381 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 SLIT3O75094 1523 aa18.91■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PTH1RQ03431 593 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 RAD50Q92878 1312 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 SIL1Q9H173 461 aa18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP18.9■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.62
NISCH-202ENST00000420808 NCAPD2Q15021 1401 aa18.89■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms