RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415164.5

UBXN4-202, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-202ENST00000415164 CANXP27824 592 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 TM4SF1P30408 202 aa26.11■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 APLP1P51693 650 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 TTC5Q8N0Z6 440 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 NARFQ9UHQ1 456 aa26.1■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 NFIXQ14938 502 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 MRC1P22897 1456 aa26.09■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.08■■□□□ 1.77
UBXN4-202ENST00000415164 SERPINB2P05120 415 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 RASSF7Q02833 373 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 KDM2BQ8NHM5 1336 aa26.06■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 TEFQ10587 303 aa26.05■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 ADAMTS7Q9UKP4 1686 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 RRAGCQ9HB90 399 aa26.04■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 STARD3NLO95772 234 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.03■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 C2CD5Q86YS7 1000 aa26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP26.02■■□□□ 1.76
UBXN4-202ENST00000415164 GNAT3A8MTJ3 354 aa26■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 A0A087WZG4 1122 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 HTRA3P83110 453 aa25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 H0YIN7 160 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 TTLL6Q8N841 843 aa25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP25.98■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 CARMIL3Q8ND23 1372 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF790Q6PG37 636 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 CCDC24Q8N4L8 307 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 IL17REQ8NFR9 667 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa25.97■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 NPHP1O15259 732 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 EIF5P55010 431 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 TBC1D9BQ66K14 1250 aa25.96■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP25.96■■□□□ 1.753e-8■■□□□ 11.4
UBXN4-202ENST00000415164 HEG1Q9ULI3 1381 aa25.95■■□□□ 1.75
UBXN4-202ENST00000415164 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 LMNB1P20700 586 aa25.94■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 FSTL1Q12841 308 aa25.94■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 FMNL2Q96PY5 1086 aa25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 UBR2Q8IWV8 1755 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 PRKAR2BP31323 418 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 CFAP53Q96M91 514 aa25.92■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 BTBD11A6QL63 1104 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 A1BGP04217 495 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.91■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 SMC1BQ8NDV3 1235 aa25.9■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 WDR90Q96KV7 1748 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 KCNQ3O43525 872 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 PDE6BP35913 854 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 PRELPP51888 382 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 PHACTR3Q96KR7 559 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa25.89■■□□□ 1.74
UBXN4-202ENST00000415164 SBF1O95248 1867 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 PRR5LQ6MZQ0 368 aa25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 GLTPD2A6NH11 291 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 NFKBIEO00221 500 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 C21orf2O43822 256 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 KLRG1Q96E93 195 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 SETDB2Q96T68 719 aa25.87■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 CNBD1Q8NA66 436 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 NUDCQ9Y266 331 aa25.86■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.85■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 DLEC1Q9Y238 1755 aa25.84■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 ST5P78524 1137 aa25.84■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 SCN7AQ01118 1682 aa25.83■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 CAMTA2O94983 1202 aa25.83■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 MCM10Q7L590 875 aa25.83■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa25.83■■□□□ 1.73
UBXN4-202ENST00000415164 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa25.82■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 DPY19L2Q6NUT2 758 aa25.82■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 USP16Q9Y5T5 823 aa25.82■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa25.81■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 ERFEQ4G0M1 354 aa25.81■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 TIAM2Q8IVF5 1701 aa25.8■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 DCTN1Q14203 1278 aa25.79■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.79■■□□□ 1.72
UBXN4-202ENST00000415164 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
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