RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402521.7

EFTUD2-201, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene EFTUD2, Length 3,045 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-201ENST00000402521 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 G2E3Q7L622 706 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ARXQ96QS3 562 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCA3Q99758 1704 aa11.31□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ANXA1P04083 346 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 SSFA2P28290 1259 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 GAS2L2Q8NHY3 880 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 CPDO75976 1380 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 LRSAM1Q6UWE0 723 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 MBD3O95983 291 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC4A2P04920 1241 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 DLG5Q8TDM6 1919 aa11.3□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 GNAT3A8MTJ3 354 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 CHL1O00533 1208 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC4A10Q6U841 1118 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 BTG4Q9NY30 223 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ABCC4O15439 1325 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 HSPA1LP34931 641 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.29□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 IL17RAQ96F46 866 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 UQCRHLA0A096LP55 91 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 UQCRHP07919 91 aa11.28□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 APBB1O00213 710 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 LMOD3Q0VAK6 560 aa11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.6
EFTUD2-201ENST00000402521 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 RBSNQ9H1K0 784 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 EVA1CP58658 441 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 SLC39A6Q13433 755 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 UVSSAQ2YD98 709 aa11.27□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 LNPKQ9C0E8 428 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 COL5A2P05997 1499 aaPredicted RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 MYRIPQ8NFW9 859 aa11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP11.26□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 LMO7Q8WWI1 1683 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 MCM2P49736 904 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 DMTNQ08495 405 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 USP26Q9BXU7 913 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 AK9Q5TCS8 1911 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 WDR17Q8IZU2 1322 aa11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP11.25□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 MEGF6O75095 1541 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 ST18O60284 1047 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 NCLP19338 710 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 CRB1P82279 1406 aa11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP11.24□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 TTC22Q5TAA0 569 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 NCAPD2Q15021 1401 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM208AQ9UK61 1670 aaKnown RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 MCTP1Q6DN14 999 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 GPT2Q8TD30 523 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 DCTPP1Q9H773 170 aa11.23□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PHF14O94880 888 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 KIF20AO95235 890 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 KIAA2012Q0VF49 1180 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 ANKRD45Q5TZF3 282 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 C8orf37Q96NL8 207 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 TEFQ10587 303 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 BTBD11A6QL63 1104 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 SPTLC3Q9NUV7 552 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 FAM13BQ9NYF5 915 aa11.22□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 C1orf141Q5JVX7 400 aa11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
EFTUD2-201ENST00000402521 MAP3K5Q99683 1374 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 TATP17735 454 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 CUL4AQ13619 759 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 CASC1Q6TDU7 716 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 SIRT2Q8IXJ6 389 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.21□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 CYP27B1O15528 508 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 REC8O95072 547 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 TMEM87AQ8NBN3 555 aa11.2□□□□□ -0.62
EFTUD2-201ENST00000402521 MEIS3Q99687 375 aa11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 114.8 ms