RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376189.5

PRAMEF6-201, Transcript of PRAME family member 6, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRAMEF6, Length 1,720 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF6-201ENST00000376189 SEPT12Q8IYM1 358 aa15.04■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 CACNA1FO60840 1977 aa15.04■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 FAM182BQ5T319 152 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 ASAP1Q9ULH1 1129 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 COG6Q9Y2V7 657 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 NBR1Q14596 966 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.03■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 NHSQ6T4R5 1651 aa15.02■□□□□ -0
PRAMEF6-201ENST00000376189 ANXA1P04083 346 aa15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 ATG3Q9NT62 314 aa15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 RGS12O14924 1447 aa15.02□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 SBF2Q86WG5 1849 aa15.01□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 KCNQ2O43526 872 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 TJP1Q07157 1748 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PROSER3Q2NL68 480 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 TMEM57Q8N5G2 664 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 ARHGAP45Q92619 1136 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 USP16Q9Y5T5 823 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 BTAF1O14981 1849 aa15□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 FLIIQ13045 1269 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 ITPRIPQ8IWB1 547 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 ABCC4O15439 1325 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PTPRCP08575 1304 aa14.99□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 MVPQ14764 893 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 KDM2BQ8NHM5 1336 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 F6X3S4 739 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PTF1AQ7RTS3 328 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 CHMP4AQ9BY43 222 aa14.97□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 MYL6BP14649 208 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PDIA6Q15084 440 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 SLC4A9Q96Q91 983 aa14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
PRAMEF6-201ENST00000376189 PALLDQ8WX93 1383 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 KRT27Q7Z3Y8 459 aa14.95□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 SLC4A10Q6U841 1118 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 DDRGK1Q96HY6 314 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 HYPKQ9NX55 129 aa14.94□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 A1BGP04217 495 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 RXRBP28702 533 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 POTEAQ6S8J7 498 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 DDX19BQ9UMR2 479 aa14.93□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 PXDNLA1KZ92 1463 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 NBPF26B4DH59 902 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 NBPF14Q5TI25 921 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 NBPF15Q8N660 670 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 ADCY9O60503 1353 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.92□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 ERBB4Q15303 1308 aa14.91□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 LY75O60449 1722 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 NUP188Q5SRE5 1749 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 PI4KAP2A4QPH2 592 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 ATP6V1AP38606 617 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 SIK1P57059 783 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 COPS6Q7L5N1 327 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.9□□□□□ -0.02
PRAMEF6-201ENST00000376189 STARD3NLO95772 234 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 RREB1Q92766 1687 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 CCT4P50991 539 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 ITPK1Q13572 414 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 DNAAF4Q8WXU2 420 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 KCNQ4P56696 695 aa14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
PRAMEF6-201ENST00000376189 C1orf115Q9H7X2 142 aa14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms