RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375150.6

PRRT1-202, Transcript of proline rich transmembrane protein 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRT1, Length 1,726 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT1-202ENST00000375150 PTPRCP08575 1304 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 CHPF2Q9P2E5 772 aa24.13■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM27P14373 513 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 ERICH6BQ5W0A0 696 aa24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 PALLDQ8WX93 1383 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 USP16Q9Y5T5 823 aa24.1■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 ERBB4Q15303 1308 aa24.09■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP24.09■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 FLIIQ13045 1269 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 CLUAP1Q96AJ1 413 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 HYPKQ9NX55 129 aa24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
PRRT1-202ENST00000375150 PANK1Q8TE04 598 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 TJP1Q07157 1748 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 G2E3Q7L622 706 aa24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP24.07■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 STARD3NLO95772 234 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 CRBNQ96SW2 442 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 TNNQ9UQP3 1299 aa24.06■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 RLBP1P12271 317 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 SIK1P57059 783 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 DNAJC10Q8IXB1 793 aa24.05■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 PDIA6Q15084 440 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 PTF1AQ7RTS3 328 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A9Q96Q91 983 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 ABCC4O15439 1325 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 ANXA1P04083 346 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 PROSER3Q2NL68 480 aa24.04■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 EP400Q96L91 3159 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 ATP6V1AP38606 617 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 COG6Q9Y2V7 657 aa24.02■■□□□ 1.44
PRRT1-202ENST00000375150 MYL6BP14649 208 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 LY75O60449 1722 aa24.01■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP24■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 TMEM57Q8N5G2 664 aa24■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 TRIM37O94972 964 aa23.99■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.99■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 A1BGP04217 495 aa23.99■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF26B4DH59 902 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF14Q5TI25 921 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 NBPF15Q8N660 670 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 DDX19BQ9UMR2 479 aa23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP23.97■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.97■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 F6X3S4 739 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 ITPK1Q13572 414 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 AAMPQ13685 434 aa23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PRRT1-202ENST00000375150 RREB1Q92766 1687 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CCT4P50991 539 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 SLC4A10Q6U841 1118 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 COPS6Q7L5N1 327 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 PPP4R2Q9NY27 417 aa23.95■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 KSR2Q6VAB6 950 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ADCY9O60503 1353 aa23.94■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 DNAAF4Q8WXU2 420 aa23.93■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.93■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CRKLP46109 303 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa23.92■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 TAF1LQ8IZX4 1826 aa23.91■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ATP10DQ9P241 1426 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 LINC00116Q8NCU8 138 aa23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa23.89■■□□□ 1.42
PRRT1-202ENST00000375150 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.89■■□□□ 1.41
PRRT1-202ENST00000375150 SLC27A3Q5K4L6 730 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRT1-202ENST00000375150 NUP188Q5SRE5 1749 aa23.88■■□□□ 1.41
PRRT1-202ENST00000375150 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP23.87■■□□□ 1.41
PRRT1-202ENST00000375150 KCNQ4P56696 695 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.7 ms