RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368202.4

PTPRK-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRK, Length 526 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-201ENST00000368202 RGS12O14924 1447 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 PDE3AQ14432 1141 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ARHGAP45Q92619 1136 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 CHPF2Q9P2E5 772 aa15.51■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 PALLDQ8WX93 1383 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 STARD3NLO95772 234 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 CLUAP1Q96AJ1 413 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 HYPKQ9NX55 129 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 USP16Q9Y5T5 823 aa15.5■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ERBB4Q15303 1308 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 TJP1Q07157 1748 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF831Q5JPB2 1677 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ILDR2Q71H61 639 aa15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.49■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM27P14373 513 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 MYL6BP14649 208 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ATP6V1AP38606 617 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 FLIIQ13045 1269 aa15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 LY75O60449 1722 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 DDX58O95786 925 aaKnown RBP15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 SIK1P57059 783 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 DNAJC10Q8IXB1 793 aa15.47■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 TRIM37O94972 964 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 C20orf194Q5TEA3 1177 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 PANK1Q8TE04 598 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 CRBNQ96SW2 442 aa15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP15.46■□□□□ 0.07
PTPRK-201ENST00000368202 ANXA1P04083 346 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 G2E3Q7L622 706 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 ITPRIPQ8IWB1 547 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 COG6Q9Y2V7 657 aa15.45■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 SLC4A10Q6U841 1118 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.44■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 A1BGP04217 495 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 MVPQ14764 893 aaKnown RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 DDX19BQ9UMR2 479 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 TNNQ9UQP3 1299 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 ABCC4O15439 1325 aa15.43■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PXDNLA1KZ92 1463 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PROSER3Q2NL68 480 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 RIC3Q7Z5B4 369 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 TMEM57Q8N5G2 664 aa15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.42■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 TAF1LQ8IZX4 1826 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 RLBP1P12271 317 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 CCT4P50991 539 aaKnown RBP15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PDIA6Q15084 440 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 COPS6Q7L5N1 327 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PTF1AQ7RTS3 328 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 XAGE3Q8WTP9 111 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 SLC4A9Q96Q91 983 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 ARXQ96QS3 562 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.41■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 F6X3S4 739 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 NEXNQ0ZGT2 675 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 AAMPQ13685 434 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 DNAAF4Q8WXU2 420 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC87Q9NVE4 849 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 RREB1Q92766 1687 aa15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP15.4■□□□□ 0.06
PTPRK-201ENST00000368202 PI4KAP2A4QPH2 592 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 APBA3O96018 575 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 CRKLP46109 303 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 KSR2Q6VAB6 950 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa15.39■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF26B4DH59 902 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 ITPK1Q13572 414 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF14Q5TI25 921 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 NBPF15Q8N660 670 aa15.38■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 PLBD2Q8NHP8 589 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 CCDC136Q96JN2 1154 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa15.37■□□□□ 0.05
PTPRK-201ENST00000368202 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms