RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367396.7

DENND1B-204, Transcript of DENN domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene DENND1B, Length 2,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENND1B-204ENST00000367396 ADCY9O60503 1353 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 NBR1Q14596 966 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 FAM161AQ3B820 660 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 C8orf34Q49A92 452 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 GLI3P10071 1580 aa28.16■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 HYPKQ9NX55 129 aa28.15■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.14■■■□□ 2.1
DENND1B-204ENST00000367396 USP16Q9Y5T5 823 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 WNK3Q9BYP7 1800 aa28.13■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 UBR2Q8IWV8 1755 aa28.12■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 GNAI2P04899 355 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 GNAI3P08754 354 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 DEKP35659 375 aaKnown RBP28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 CHD1LQ86WJ1 897 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 USP44Q9H0E7 712 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 PAPPAQ13219 1627 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 BEND3Q5T5X7 828 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 LNPKQ9C0E8 428 aa28.11■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 DCTPP1Q9H773 170 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 ANKRD45Q5TZF3 282 aa28.1■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 KSR2Q6VAB6 950 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP28.09■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.09■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 KCPQ6ZWJ8 1503 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 SLIT2O94813 1529 aa28.08■■■□□ 2.09
DENND1B-204ENST00000367396 MYL6BP14649 208 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 LAMB4A4D0S4 1761 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 NWD2Q9ULI1 1742 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 EXOC5O00471 708 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 DDRGK1Q96HY6 314 aa28.07■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP28.06■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 TMOD3Q9NYL9 352 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 TNS2Q63HR2 1409 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 LRP10Q7Z4F1 713 aa28.06■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 JCADQ9P266 1359 aa28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 DDX58O95786 925 aaKnown RBP28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP28.04■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 CERKQ8TCT0 537 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 ITGB4P16144 1822 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 HMMRO75330 724 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 XAGE3Q8WTP9 111 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 PIGBQ92521 554 aa28.03■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP28.02■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 COPS6Q7L5N1 327 aa28.01■■■□□ 2.08
DENND1B-204ENST00000367396 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP28.01■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 LRP6O75581 1613 aa28■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 ATP8B2P98198 1209 aa28■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa27.99■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 ALDH1L1O75891 902 aa27.99■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 ASAP1Q9ULH1 1129 aa27.99■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 KAT6BQ8WYB5 2073 aa27.98■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 RIC3Q7Z5B4 369 aa27.98■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP27.98■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 NBPF26B4DH59 902 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 DDB1Q16531 1140 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 NBPF14Q5TI25 921 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 NBPF15Q8N660 670 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 LINS1Q8NG48 757 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 C8orf37Q96NL8 207 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 ATG3Q9NT62 314 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 ERBB4Q15303 1308 aa27.97■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 UNC5CLQ8IV45 518 aa27.96■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 BCL9O00512 1426 aa27.96■■■□□ 2.07
DENND1B-204ENST00000367396 BARGINQ6ZT62 677 aa27.94■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa27.94■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 NGLY1Q96IV0 654 aa27.94■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 A1BGP04217 495 aa27.94■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 BCL9LQ86UU0 1499 aa27.94■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 APBB1O00213 710 aa27.93■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 IGKV5-2P06315 115 aa27.93■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP27.93■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP27.92■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.92■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa27.92■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 SEC24BO95487 1268 aa27.91■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 SSH3Q8TE77 659 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 MYD88Q99836 296 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 NEXNQ0ZGT2 675 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 VSIG10Q8N0Z9 540 aa27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP27.9■■■□□ 2.06
DENND1B-204ENST00000367396 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa27.9■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms