RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366554.2

OPN3-201, Transcript of opsin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene OPN3, Length 2,620 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPN3-201ENST00000366554 MTMR6Q9Y217 621 aa25.89■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa25.88■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 CYP2C19P33261 490 aa25.88■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 RUFY3Q7L099 469 aa25.88■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.88■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.88■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 AK2P54819 239 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 TRIM5Q9C035 493 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ABCC3O15438 1527 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 UNC5CLQ8IV45 518 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ZNF592Q92610 1267 aa25.87■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ERO1AQ96HE7 468 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 NUP62CLQ9H1M0 184 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 TAF7LQ5H9L4 462 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ZNF446Q9NWS9 450 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 STAP2Q9UGK3 403 aa25.86■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 TSPYL1Q9H0U9 437 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 V9GYY5 206 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 CCDC171Q6TFL3 1326 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 IL13P35225 146 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 CCDC144BQ3MJ40 725 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 LRRCC1Q9C099 1032 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ERBB3P21860 1342 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 RAD50Q92878 1312 aa25.85■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 MAPK8IP2Q13387 824 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ELF2Q15723 593 aa25.84■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 ANO6Q4KMQ2 910 aa25.84■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 DCTN1Q14203 1278 aa25.84■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.84■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 DLG5Q8TDM6 1919 aa25.83■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 CAMK4Q16566 473 aa25.83■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
OPN3-201ENST00000366554 LIG1P18858 919 aa25.83■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 CLIP2Q9UDT6 1046 aa25.83■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 USP27XA6NNY8 438 aa25.82■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 TTC6Q86TZ1 520 aa25.82■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 GJB2P29033 226 aa25.82■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 NPATQ14207 1427 aa25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 PTPN14Q15678 1187 aa25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 LRRC8AQ8IWT6 810 aa25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 CDC25BP30305 580 aa25.81■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 LARGE1O95461 756 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 TRIM34Q9BYJ4 488 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 KIF20BQ96Q89 1820 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 AEBP1Q8IUX7 1158 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 CKAP2LQ8IYA6 745 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 ELP1O95163 1332 aa25.8■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP25.79■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 RASEFQ8IZ41 740 aa25.79■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 H2AFXP16104 143 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP25.79■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 TNMDQ9H2S6 317 aa25.79■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 SLU7O95391 586 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 ZKSCAN7Q9P0L1 754 aaPredicted RBP25.78■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 NEMFO60524 1076 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 CHMP3Q9Y3E7 222 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 RNF20Q5VTR2 975 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 HYPKQ9NX55 129 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 DACT1Q9NYF0 836 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 FHOD1Q9Y613 1164 aa25.77■■□□□ 1.72
OPN3-201ENST00000366554 GNAI2P04899 355 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CCDC83Q8IWF9 413 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 AOX1Q06278 1338 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CHL1O00533 1208 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SGSM2O43147 1006 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 ZNF165P49910 485 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 KRT85P78386 507 aa25.76■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP25.75■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa25.75■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.75■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 STK26Q9P289 416 aa25.75■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CCT4P50991 539 aaKnown RBP25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 ARID5BQ14865 1188 aa25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 TRERF1Q96PN7 1200 aa25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 CABP1Q9NZU7 370 aa25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 SLC4A2P04920 1241 aa25.74■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 DTNBO60941 627 aa25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 KCND1Q9NSA2 647 aa25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP25.73■■□□□ 1.71
OPN3-201ENST00000366554 PTPRMP28827 1452 aa25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.4 ms