RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000359238.6

SNX11-201, Transcript of sorting nexin 11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNX11, Length 2,315 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX11-201ENST00000359238 PANK2Q9BZ23 570 aa23.08■■□□□ 1.29
SNX11-201ENST00000359238 LNPKQ9C0E8 428 aa23.08■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 MRE11P49959 708 aa23.07■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 PROSER3Q2NL68 480 aa23.07■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 C5P01031 1676 aa23.06■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 SLC52A2Q9HAB3 445 aa23.05■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 HEG1Q9ULI3 1381 aa23.05■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
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SNX11-201ENST00000359238 DCAF5Q96JK2 942 aa23.04■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa23.04■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa23.04■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa23.04■■□□□ 1.28
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SNX11-201ENST00000359238 SHANK3Q9BYB0 1731 aa23.03■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 ARXQ96QS3 562 aa23.03■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 CEP85Q6P2H3 762 aa23.03■■□□□ 1.28
SNX11-201ENST00000359238 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF790Q6PG37 636 aa23.01■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 TRAK2O60296 914 aa23■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 CHD1LQ86WJ1 897 aa23■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 ESPNB1AK53 854 aa22.99■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 CABP4P57796 275 aa22.98■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.98■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.98■■□□□ 1.27
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SNX11-201ENST00000359238 MRC1P22897 1456 aa22.97■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 GRPEL1Q9HAV7 217 aa22.97■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 PDIA6Q15084 440 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 USP44Q9H0E7 712 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 GLI3P10071 1580 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 APBB1O00213 710 aa22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
SNX11-201ENST00000359238 GCC1Q96CN9 775 aa22.94■■□□□ 1.26
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SNX11-201ENST00000359238 TPM2P07951 284 aa22.94■■□□□ 1.26
SNX11-201ENST00000359238 USP16Q9Y5T5 823 aa22.94■■□□□ 1.26
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SNX11-201ENST00000359238 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
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SNX11-201ENST00000359238 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP22.91■■□□□ 1.26
SNX11-201ENST00000359238 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
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SNX11-201ENST00000359238 MYL6BP14649 208 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX11-201ENST00000359238 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX11-201ENST00000359238 JCADQ9P266 1359 aa22.9■■□□□ 1.26
SNX11-201ENST00000359238 GNAI2P04899 355 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 C8orf37Q96NL8 207 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.89■■□□□ 1.25
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SNX11-201ENST00000359238 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa22.89■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa22.88■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 FMNL2Q96PY5 1086 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 PDCL3Q9H2J4 239 aa22.87■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SLIT2O94813 1529 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 TRIM44Q96DX7 344 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 CHMP4AQ9BY43 222 aa22.86■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.86■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 EXOC5O00471 708 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 NGLY1Q96IV0 654 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 C22orf23Q9BZE7 217 aa22.85■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 KAT6BQ8WYB5 2073 aa22.84■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa22.84■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 UBR2Q8IWV8 1755 aa22.84■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SNX11-201ENST00000359238 GNAI3P08754 354 aa22.83■■□□□ 1.25
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