RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355530.6

SPNS3-201, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene SPNS3, Length 2,133 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.13■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 NFAT5O94916 1531 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 PDLIM2Q96JY6 352 aa22.12■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 SURF6O75683 361 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 KCNA6P17658 529 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 KIF1BPQ96EK5 621 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 RAD50Q92878 1312 aa22.11■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 MSNP26038 577 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 NUTM1Q86Y26 1132 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 RHPN1Q8TCX5 695 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 CHAMP1Q96JM3 812 aa22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 SYCE3A1L190 88 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 USHBP1Q8N6Y0 703 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 SRGAP3O43295 1099 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 IL25Q9H293 177 aa22.09■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 SGSM2O43147 1006 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 IP6K1Q92551 441 aa22.08■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
SPNS3-201ENST00000355530 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 CNTROBQ8N137 903 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHG5O94827 1062 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 BEND3Q5T5X7 828 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 C14orf37Q86TY3 774 aa22.06■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 TPM2P07951 284 aa22.05■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 RGPD2P0DJD1 1756 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PHF8Q9UPP1 1060 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 NCAPD2Q15021 1401 aa22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PHF14O94880 888 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 ADCY9O60503 1353 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 OFD1O75665 1012 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 NBPF6Q5VWK0 638 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PLPPR3Q6T4P5 718 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 NBPF4Q96M43 638 aa22.03■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 SNX14Q9Y5W7 946 aa22.03■■□□□ 1.12
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SPNS3-201ENST00000355530 TTC14Q96N46 770 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 LGR6Q9HBX8 967 aa22.02■■□□□ 1.12
SPNS3-201ENST00000355530 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 TEFQ10587 303 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 AKAP4Q5JQC9 854 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 TMEM87AQ8NBN3 555 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 TSPY26PQ9H489 355 aa22.01■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa22■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 KCNH5Q8NCM2 988 aa22■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 BTBD11A6QL63 1104 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 MCM5P33992 734 aa21.99■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
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SPNS3-201ENST00000355530 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 CCDC39Q9UFE4 941 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 AK2P54819 239 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 RUFY2Q8WXA3 655 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 TCHHQ07283 1943 aa21.98■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 ALDH1L1O75891 902 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 GPATCH3Q96I76 525 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 KCNQ3O43525 872 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 TERF1P54274 439 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 USP48Q86UV5 1035 aa21.97■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 ERC1Q8IUD2 1116 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 RASEFQ8IZ41 740 aa21.96■■□□□ 1.11
SPNS3-201ENST00000355530 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.96■■□□□ 1.11
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