RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000337004.8

PTDSS1-201, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTDSS1, Length 2,366 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-201ENST00000337004 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 LRSAM1Q6UWE0 723 aa26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 IP6K1Q92551 441 aa26.06■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 HS1BP3Q53T59 392 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 CHAMP1Q96JM3 812 aa26.05■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.04■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 MSNP26038 577 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 PI4K2BQ8TCG2 481 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 BEND3Q5T5X7 828 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 CNTROBQ8N137 903 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 PHF8Q9UPP1 1060 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.03■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 CACNA1FO60840 1977 aa26.02■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 SYCE3A1L190 88 aa26.02■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 IL25Q9H293 177 aa26.02■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.02■■□□□ 1.76
PTDSS1-201ENST00000337004 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 SGSM2O43147 1006 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 LGR6Q9HBX8 967 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 USP54Q70EL1 1684 aa26.01■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 NBPF6Q5VWK0 638 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 PDLIM2Q96JY6 352 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 NBPF4Q96M43 638 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 RAD50Q92878 1312 aa26■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.99■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP25.99■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 TEFQ10587 303 aa25.99■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.98■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHG5O94827 1062 aa25.98■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 BTBD11A6QL63 1104 aa25.97■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 AKAP4Q5JQC9 854 aa25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNH5Q8NCM2 988 aa25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC41PQ6P2S7 1318 aa25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 SNX14Q9Y5W7 946 aa25.96■■□□□ 1.75
PTDSS1-201ENST00000337004 OS9Q13438 667 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP25.95■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 KCNQ3O43525 872 aa25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 HDAC5Q9UQL6 1122 aa25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 PHF14O94880 888 aa25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 PSME1Q06323 249 aa25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP25.93■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 MTX1Q13505 466 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 AMOTQ4VCS5 1084 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP25.92■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 TTC14Q96N46 770 aa25.92■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ZBTB7CA1YPR0 619 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 TSPY26PQ9H489 355 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ADCY9O60503 1353 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 OFD1O75665 1012 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 TPM2P07951 284 aa25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP25.91■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ALDH1L1O75891 902 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ANXA1P04083 346 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 USP48Q86UV5 1035 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.9■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 AK2P54819 239 aa25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 RASEFQ8IZ41 740 aa25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 GPATCH3Q96I76 525 aa25.89■■□□□ 1.74
PTDSS1-201ENST00000337004 C1orf141Q5JVX7 400 aa25.89■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 ERC1Q8IUD2 1116 aa25.89■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 NFAT5O94916 1531 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 ECHDC1Q9NTX5 307 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 SPG7Q9UQ90 795 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 GDPD2Q9HCC8 539 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa25.88■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 RNMTO43148 476 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 ESCO1Q5FWF5 840 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 KSR2Q6VAB6 950 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 TMEM87AQ8NBN3 555 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 RNF214Q8ND24 703 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 MCM5P33992 734 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 CCDC39Q9UFE4 941 aa25.87■■□□□ 1.73
PTDSS1-201ENST00000337004 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms