RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326153.9

GTPBP6-201, Transcript of GTP binding protein 6 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GTPBP6, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP6-201ENST00000326153 GNAI3P08754 354 aa26.58■■□□□ 1.85
GTPBP6-201ENST00000326153 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.85
GTPBP6-201ENST00000326153 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
GTPBP6-201ENST00000326153 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.58■■□□□ 1.85
GTPBP6-201ENST00000326153 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
GTPBP6-201ENST00000326153 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP26.58■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.57■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 CHPF2Q9P2E5 772 aa26.57■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 IL2RBP14784 551 aa26.57■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 TTC22Q5TAA0 569 aa26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 USP44Q9H0E7 712 aa26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.56■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 APBB1O00213 710 aa26.55■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 CYP27B1O15528 508 aa26.54■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 NFKBIBQ15653 356 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 CHMP4AQ9BY43 222 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 BCL11AQ9H165 835 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 ATP8B2P98198 1209 aa26.53■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 CDC45O75419 566 aa26.52■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 VPS72Q15906 364 aa26.52■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 USP21Q9UK80 565 aa26.52■■□□□ 1.84
GTPBP6-201ENST00000326153 AFF2P51816 1311 aa26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PHKG2P15735 406 aa26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SPG7Q9UQ90 795 aa26.51■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ANXA1P04083 346 aa26.5■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.49■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.49■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 BEND3Q5T5X7 828 aa26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ANTXR1Q9H6X2 564 aa26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SCN11AQ9UI33 1791 aa26.48■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa26.47■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.47■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 ADCY9O60503 1353 aa26.47■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 BARGINQ6ZT62 677 aa26.46■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 IFNL2Q8IZJ0 200 aa26.46■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 GLI3P10071 1580 aa26.46■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 KIF2CQ99661 725 aa26.45■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.45■■□□□ 1.83
GTPBP6-201ENST00000326153 SDSP20132 328 aa26.45■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 DEKP35659 375 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 PROSER3Q2NL68 480 aa26.45■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa26.44■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa26.44■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 ATRNO75882 1429 aa26.44■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.44■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC52A2Q9HAB3 445 aa26.43■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 CCDC9Q9Y3X0 531 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 PDE1AP54750 535 aa26.43■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.43■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 SSH3Q8TE77 659 aa26.42■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 TNS2Q63HR2 1409 aa26.42■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 ZNF790Q6PG37 636 aa26.41■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 SLC39A6Q13433 755 aa26.4■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 POLA2Q14181 598 aa26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 MRC1P22897 1456 aa26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.39■■□□□ 1.82
GTPBP6-201ENST00000326153 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa26.39■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.39■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 SNX21Q969T3 373 aa26.39■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 PDIA6Q15084 440 aa26.38■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 DCAF5Q96JK2 942 aa26.38■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP26.38■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.38■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 KSR2Q6VAB6 950 aa26.37■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 C5P01031 1676 aa26.37■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 HYPKQ9NX55 129 aa26.37■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 EXOC5O00471 708 aa26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 HSCBQ8IWL3 235 aa26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.36■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.35■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 TSHZ3Q63HK5 1081 aa26.35■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 DDB1Q16531 1140 aa26.34■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 ALDH1L1O75891 902 aa26.33■■□□□ 1.81
GTPBP6-201ENST00000326153 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.8 ms