RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316412.9

PRAMEF20-201, Transcript of PRAME family member 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PRAMEF20, Length 1,597 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF20-201ENST00000316412 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM27P14373 513 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 G2E3Q7L622 706 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTF1AQ7RTS3 328 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 CHPF2Q9P2E5 772 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 VSIG10Q8N0Z9 540 aa22.16■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 RLBP1P12271 317 aa22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZNF831Q5JPB2 1677 aa22.15■■□□□ 1.14
PRAMEF20-201ENST00000316412 PDIA6Q15084 440 aa22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 PANK1Q8TE04 598 aa22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 EP400Q96L91 3159 aa22.14■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERICH6BQ5W0A0 696 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 CLUAP1Q96AJ1 413 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 CRBNQ96SW2 442 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 PTPRCP08575 1304 aa22.13■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 PROSER3Q2NL68 480 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 FAM196AQ6ZSG2 479 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANXA1P04083 346 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 MS4A1P11836 297 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 FLIIQ13045 1269 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 PALLDQ8WX93 1383 aa22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 LY75O60449 1722 aa22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.11■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 ABCC4O15439 1325 aa22.1■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 LRP10Q7Z4F1 713 aa22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 ERBB4Q15303 1308 aa22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 SIK1P57059 783 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 HYPKQ9NX55 129 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 COG6Q9Y2V7 657 aa22.08■■□□□ 1.13
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF26B4DH59 902 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 A1BGP04217 495 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF14Q5TI25 921 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 TMEM57Q8N5G2 664 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 NBPF15Q8N660 670 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 RREB1Q92766 1687 aa22.07■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 MVPQ14764 893 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 TAF1LQ8IZX4 1826 aa22.05■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 STARD3NLO95772 234 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 MYL6BP14649 208 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 F6X3S4 739 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP6V1AP38606 617 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITPK1Q13572 414 aa22.04■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 TRIM37O94972 964 aa22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 ADCY9O60503 1353 aa22.02■■□□□ 1.12
PRAMEF20-201ENST00000316412 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 XAGE3Q8WTP9 111 aa22.01■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 COPS6Q7L5N1 327 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 PPP4R2Q9NY27 417 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 NUP188Q5SRE5 1749 aa22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX19BQ9UMR2 479 aa21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 KSR2Q6VAB6 950 aa21.99■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.98■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 CRKLP46109 303 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC125Q86Z20 511 aa21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 DNAAF4Q8WXU2 420 aa21.97■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 DDX58O95786 925 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCT4P50991 539 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 KCNQ4P56696 695 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 LINC00116Q8NCU8 138 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCDC87Q9NVE4 849 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa21.96■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 ATP10DQ9P241 1426 aa21.95■■□□□ 1.11
PRAMEF20-201ENST00000316412 AAMPQ13685 434 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 BEND3Q5T5X7 828 aa21.94■■□□□ 1.1
PRAMEF20-201ENST00000316412 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.94■■□□□ 1.1
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