RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313173.5

HOXD8-201, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-201ENST00000313173 USP44Q9H0E7 712 aa33.45■■■□□ 2.95
HOXD8-201ENST00000313173 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP33.45■■■□□ 2.95
HOXD8-201ENST00000313173 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP33.45■■■□□ 2.95
HOXD8-201ENST00000313173 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP33.44■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 SEC24BO95487 1268 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 BEND3Q5T5X7 828 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 DDRGK1Q96HY6 314 aa33.43■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 FMNL2Q96PY5 1086 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 JCADQ9P266 1359 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 GLI3P10071 1580 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 ERVV-2B6SEH9 535 aa33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP33.41■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 PDIA6Q15084 440 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 BMP2KLQ5H9B9 411 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 KSR2Q6VAB6 950 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 ERICH6Q7L0X2 663 aa33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP33.4■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 LAMB4A4D0S4 1761 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 ATP8B2P98198 1209 aa33.39■■■□□ 2.94
HOXD8-201ENST00000313173 PAPPAQ13219 1627 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 UBR2Q8IWV8 1755 aa33.37■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 DDX58O95786 925 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 USP35Q9P2H5 1018 aa33.36■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 PLCH1Q4KWH8 1693 aa33.35■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP33.35■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 ALDH1L1O75891 902 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 HSPA1LP34931 641 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa33.34■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 DISP2A7MBM2 1401 aa33.33■■■□□ 2.93
HOXD8-201ENST00000313173 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa33.32■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa33.32■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 USP16Q9Y5T5 823 aa33.31■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 KCPQ6ZWJ8 1503 aa33.29■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP33.29■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 APBB1O00213 710 aa33.28■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP33.28■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP33.28■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 SSH3Q8TE77 659 aa33.28■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 WNK3Q9BYP7 1800 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 TNS2Q63HR2 1409 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 MYL6BP14649 208 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 LRP10Q7Z4F1 713 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 LINS1Q8NG48 757 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D32Q96NH3 1257 aa33.27■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP33.26■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa33.26■■■□□ 2.92
HOXD8-201ENST00000313173 XAGE3Q8WTP9 111 aa33.26■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa33.25■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 ERBB4Q15303 1308 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 POLA2Q14181 598 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 NRAPQ86VF7 1730 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 SLIT2O94813 1529 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 TTC22Q5TAA0 569 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 RIC3Q7Z5B4 369 aa33.24■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 COPS6Q7L5N1 327 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP33.23■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 HDAC5Q9UQL6 1122 aa33.23■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 LRRCC1Q9C099 1032 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP33.22■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 C8orf37Q96NL8 207 aa33.22■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP33.22■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP33.2■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 UTYO14607 1347 aa33.2■■■□□ 2.91
HOXD8-201ENST00000313173 LRP6O75581 1613 aa33.2■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 NWD2Q9ULI1 1742 aa33.2■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 NGLY1Q96IV0 654 aa33.2■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 TMOD3Q9NYL9 352 aa33.2■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 NEXNQ0ZGT2 675 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 MTX1Q13505 466 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP33.18■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 BCL11AQ9H165 835 aa33.18■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 GRM8O00222 908 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 SRGAP3O43295 1099 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 OSBPL3Q9H4L5 887 aa33.17■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 IGKV5-2P06315 115 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 RAB11FIP3O75154 756 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 CDC45O75419 566 aa33.16■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP33.16■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 ITGB4P16144 1822 aa33.15■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa33.15■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 UNC5CLQ8IV45 518 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 C22orf23Q9BZE7 217 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 SALL3Q9BXA9 1300 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 NEURL1BA8MQ27 555 aa33.14■■■□□ 2.9
HOXD8-201ENST00000313173 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP33.12■■■□□ 2.89
HOXD8-201ENST00000313173 PDE1AP54750 535 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXD8-201ENST00000313173 MYD88Q99836 296 aa33.12■■■□□ 2.89
HOXD8-201ENST00000313173 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP33.12■■■□□ 2.89
HOXD8-201ENST00000313173 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms