RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311308.6

TTC9B-201, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 9B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TTC9B, Length 843 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC9B-201ENST00000311308 NEFMP07197 916 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 DPEP1P16444 411 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 C1QTNF8P60827 252 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 HEG1Q9ULI3 1381 aa26.92■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 A0A087WZG4 1122 aa26.91■■□□□ 1.9
TTC9B-201ENST00000311308 BTBD11A6QL63 1104 aa26.91■■□□□ 1.9
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TTC9B-201ENST00000311308 NFIXQ14938 502 aa26.85■■□□□ 1.89
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TTC9B-201ENST00000311308 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa26.84■■□□□ 1.89
TTC9B-201ENST00000311308 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
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TTC9B-201ENST00000311308 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.82■■□□□ 1.88
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TTC9B-201ENST00000311308 MCM10Q7L590 875 aa26.82■■□□□ 1.88
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TTC9B-201ENST00000311308 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa26.81■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.8■■□□□ 1.88
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TTC9B-201ENST00000311308 KCNQ3O43525 872 aa26.79■■□□□ 1.88
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TTC9B-201ENST00000311308 CHRNA5P30532 468 aa26.78■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.78■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 A1BGP04217 495 aa26.77■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 DCTN1Q14203 1278 aa26.77■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa26.77■■□□□ 1.88
TTC9B-201ENST00000311308 RALBP1Q15311 655 aa26.76■■□□□ 1.87
TTC9B-201ENST00000311308 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP26.76■■□□□ 1.87
TTC9B-201ENST00000311308 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa26.75■■□□□ 1.87
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TTC9B-201ENST00000311308 H0YIN7 160 aa26.72■■□□□ 1.87
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TTC9B-201ENST00000311308 ZNF652Q9Y2D9 606 aa26.7■■□□□ 1.86
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TTC9B-201ENST00000311308 BRIP1Q9BX63 1249 aa26.68■■□□□ 1.86
TTC9B-201ENST00000311308 NRXN2Q9P2S2 1712 aa26.68■■□□□ 1.86
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TTC9B-201ENST00000311308 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.67■■□□□ 1.86
TTC9B-201ENST00000311308 ST5P78524 1137 aa26.66■■□□□ 1.86
TTC9B-201ENST00000311308 CNBD1Q8NA66 436 aa26.66■■□□□ 1.86
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TTC9B-201ENST00000311308 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.65■■□□□ 1.86
TTC9B-201ENST00000311308 RNF181Q9P0P0 153 aa26.65■■□□□ 1.86
TTC9B-201ENST00000311308 RGL2O15211 777 aa26.63■■□□□ 1.85
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TTC9B-201ENST00000311308 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
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TTC9B-201ENST00000311308 LMNB1P20700 586 aa26.58■■□□□ 1.85
TTC9B-201ENST00000311308 RIPK4P57078 832 aa26.58■■□□□ 1.85
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TTC9B-201ENST00000311308 CCDC24Q8N4L8 307 aa26.58■■□□□ 1.85
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TTC9B-201ENST00000311308 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP26.58■■□□□ 1.85
TTC9B-201ENST00000311308 HSPA6P17066 643 aa26.57■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.57■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 CNKSR1Q969H4 720 aa26.57■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 TOMM70O94826 608 aa26.56■■□□□ 1.84
TTC9B-201ENST00000311308 RASSF7Q02833 373 aa26.56■■□□□ 1.84
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