RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298838.10

PACSIN3-201, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PACSIN3, Length 1,843 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-201ENST00000298838 FLIIQ13045 1269 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 ABCC4O15439 1325 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 MVPQ14764 893 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 G2E3Q7L622 706 aa26.37■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS12O14924 1447 aa26.36■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 USP16Q9Y5T5 823 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 NHSQ6T4R5 1651 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 VSIG10Q8N0Z9 540 aa26.35■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.34■■□□□ 1.81
PACSIN3-201ENST00000298838 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 HYPKQ9NX55 129 aa26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 KCNQ2O43526 872 aa26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.32■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 ERBB4Q15303 1308 aa26.31■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP26.31■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 SBF2Q86WG5 1849 aa26.31■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 ANXA1P04083 346 aa26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 AAMPQ13685 434 aa26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PDIA6Q15084 440 aa26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM182BQ5T319 152 aa26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PROSER3Q2NL68 480 aa26.3■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP26.29■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 BTAF1O14981 1849 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 RXRBP28702 533 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC136Q96JN2 1154 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PALLDQ8WX93 1383 aa26.28■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 TJP1Q07157 1748 aa26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
PACSIN3-201ENST00000298838 PXDNLA1KZ92 1463 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 F6X3S4 739 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 MYL6BP14649 208 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 STARD3NLO95772 234 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAJC10Q8IXB1 793 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A9Q96Q91 983 aa26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 SLC4A10Q6U841 1118 aa26.24■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 CCT4P50991 539 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF831Q5JPB2 1677 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 SIK1P57059 783 aa26.23■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.22■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 PI4KAP2A4QPH2 592 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF26B4DH59 902 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 A1BGP04217 495 aa26.21■■□□□ 1.79
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PACSIN3-201ENST00000298838 NBPF15Q8N660 670 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 ADCY9O60503 1353 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 PTF1AQ7RTS3 328 aa26.21■■□□□ 1.79
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP6V1AP38606 617 aa26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 DNAAF4Q8WXU2 420 aa26.2■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 KSR2Q6VAB6 950 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 COPS6Q7L5N1 327 aa26.19■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 POTEAQ6S8J7 498 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.18■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 EP400Q96L91 3159 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 ATP10DQ9P241 1426 aa26.17■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 LY75O60449 1722 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.15■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.14■■□□□ 1.78
PACSIN3-201ENST00000298838 ITPK1Q13572 414 aa26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 RREB1Q92766 1687 aa26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 BEND3Q5T5X7 828 aa26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 CRKLP46109 303 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 MEIS3Q99687 375 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 CCDC87Q9NVE4 849 aa26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 TRIM37O94972 964 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 TTLL7Q6ZT98 887 aa26.09■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 ALDH1L1O75891 902 aa26.08■■□□□ 1.77
PACSIN3-201ENST00000298838 LINS1Q8NG48 757 aa26.08■■□□□ 1.77
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