RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNA5P30532 468 aa10.86□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PIP4P2Q8N4L2 257 aa10.86□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PCDH10Q9P2E7 1040 aa10.86□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC34A2O95436 690 aa10.85□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CRKLP46109 303 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 MTHFSP49914 203 aa10.85□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP8Q14318 412 aa10.85□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 CHADLQ6NUI6 762 aa10.85□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 SBF1O95248 1867 aa10.85□□□□□ -0.67
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PGGT1B-201ENST00000296642 IQCA1LA6NCM1 817 aa10.84□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 HAX1O00165 279 aa10.84□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF7Q02833 373 aa10.84□□□□□ -0.67
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PGGT1B-201ENST00000296642 DDR1Q08345 913 aa10.83□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TM4SF1P30408 202 aa10.82□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.82□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 USPL1Q5W0Q7 1092 aa10.81□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 A0A087WZG4 1122 aa10.8□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 TIAM2Q8IVF5 1701 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 FOXN1O15353 648 aa10.79□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TAOK3Q9H2K8 898 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 POLKQ9UBT6 870 aa10.79□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM88BA6NKF7 163 aa10.78□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 COL15A1P39059 1388 aa10.77□□□□□ -0.68
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.68
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PGGT1B-201ENST00000296642 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP10.77□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CNKSR1Q969H4 720 aa10.77□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.76□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.76□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 CLEC11AQ9Y240 323 aa10.76□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 C21orf2O43822 256 aa10.75□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 LBX1P52954 281 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ST5P78524 1137 aa10.75□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 DEFB115Q30KQ5 88 aa10.75□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 DNAJC10Q8IXB1 793 aa10.75□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 CARMIL3Q8ND23 1372 aa10.74□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 NRXN2Q9P2S2 1712 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
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PGGT1B-201ENST00000296642 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 HACL1Q9UJ83 578 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 PASKQ96RG2 1323 aa10.73□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 TJP1Q07157 1748 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SCN4AP35499 1836 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 PCNTO95613 3336 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 RASSF10A6NK89 507 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC85CA6NKD9 419 aa10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 CANXP27824 592 aaKnown RBP10.72□□□□□ -0.69
PGGT1B-201ENST00000296642 SULT6B1Q6IMI4 303 aa10.72□□□□□ -0.69
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