RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293861.7

SNRNP25-201, Transcript of small nuclear ribonucleoprotein U11/U12 subunit 25, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best)

Gene SNRNP25, Length 1,905 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRNP25-201ENST00000293861 BTG4Q9NY30 223 aa26.74■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 LAMB4A4D0S4 1761 aa26.73■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 FMNL2Q96PY5 1086 aa26.73■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PHLPP1O60346 1717 aa26.72■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 ANXA1P04083 346 aa26.72■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PROSER3Q2NL68 480 aa26.71■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 KSR2Q6VAB6 950 aa26.71■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP26.71■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 UBR2Q8IWV8 1755 aa26.7■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 GLI3P10071 1580 aa26.7■■□□□ 1.87
SNRNP25-201ENST00000293861 PDIA6Q15084 440 aa26.69■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 ALDH1L1O75891 902 aa26.69■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 PAPPAQ13219 1627 aa26.69■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 PLCH1Q4KWH8 1693 aa26.68■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa26.68■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX58O95786 925 aaKnown RBP26.68■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 TTC22Q5TAA0 569 aa26.67■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 SSH3Q8TE77 659 aa26.67■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 DISP2A7MBM2 1401 aa26.66■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP26.66■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa26.66■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 C22orf23Q9BZE7 217 aa26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 TOM1O60784 492 aa26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 OSBPL3Q9H4L5 887 aa26.65■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 POLA2Q14181 598 aa26.64■■□□□ 1.86
SNRNP25-201ENST00000293861 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 USP35Q9P2H5 1018 aa26.63■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 CDC45O75419 566 aa26.62■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 LRRCC1Q9C099 1032 aa26.62■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa26.62■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 ERBB4Q15303 1308 aa26.62■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 BECN1Q14457 450 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 LINS1Q8NG48 757 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 USP16Q9Y5T5 823 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa26.61■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 SALL3Q9BXA9 1300 aa26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 TNS2Q63HR2 1409 aa26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 KCPQ6ZWJ8 1503 aa26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 APBB1O00213 710 aa26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 RBM25P49756 843 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 WNK3Q9BYP7 1800 aa26.6■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 MTX1Q13505 466 aa26.59■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 LRP10Q7Z4F1 713 aa26.59■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.59■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 SLC4A3P48751 1232 aa26.59■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 UTYO14607 1347 aa26.58■■□□□ 1.85
SNRNP25-201ENST00000293861 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.58■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 RAB11FIP3O75154 756 aa26.57■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 MYL6BP14649 208 aa26.57■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP26.57■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 NRAPQ86VF7 1730 aa26.57■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 XAGE3Q8WTP9 111 aa26.57■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 LRP6O75581 1613 aa26.56■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 PDE1AP54750 535 aa26.56■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.56■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 COPS6Q7L5N1 327 aa26.55■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 TMOD3Q9NYL9 352 aa26.55■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP26.55■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 SRGAP3O43295 1099 aa26.54■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 NEXNQ0ZGT2 675 aa26.54■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 SDSP20132 328 aa26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 GRM8O00222 908 aa26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 STAP2Q9UGK3 403 aa26.53■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 ITGB4P16144 1822 aa26.52■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 PIP4K2BP78356 416 aa26.52■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.52■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 NWD2Q9ULI1 1742 aa26.51■■□□□ 1.84
SNRNP25-201ENST00000293861 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa26.51■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 AOX1Q06278 1338 aa26.51■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 SURF6O75683 361 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 ADAMTS2O95450 1211 aa26.51■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 IGKV5-2P06315 115 aa26.51■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 EXOC5O00471 708 aa26.5■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 MX1P20591 662 aa26.5■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 NUP188Q5SRE5 1749 aa26.49■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 KIF1BPQ96EK5 621 aa26.49■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 TBC1D2Q9BYX2 928 aa26.49■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 BCL11AQ9H165 835 aa26.49■■□□□ 1.83
SNRNP25-201ENST00000293861 SPATA31A1Q5TZJ5 1347 aa26.48■■□□□ 1.83
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