RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 FOXD4L1Q9NU39 408 aa26.52■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
PITX1-201ENST00000265340 LMOD3Q0VAK6 560 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 KIF2CQ99661 725 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 PXDNQ92626 1479 aa26.51■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 NUCB2P80303 420 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 TERF2Q15554 542 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 VAMP4O75379 141 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 GAS2L2Q8NHY3 880 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CFAP44Q96MT7 982 aa26.5■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 TRIM34Q9BYJ4 488 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ARHGEF10O15013 1369 aa26.49■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 FAM193AP78312 1265 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CERS3Q8IU89 383 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 EYA1Q99502 592 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 USP54Q70EL1 1684 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 SYCP1Q15431 976 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ALDH1L2Q3SY69 923 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.48■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 TOM1O60784 492 aa26.47■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 GPT2Q8TD30 523 aa26.47■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CABLES1Q8TDN4 633 aa26.47■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB7CA1YPR0 619 aa26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 MCM10Q7L590 875 aa26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 C8orf58Q8NAV2 365 aa26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 CERKQ8TCT0 537 aa26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 HOXC9P31274 260 aa26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 GEMIN8Q9NWZ8 242 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP26.46■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
PITX1-201ENST00000265340 IGSF1Q8N6C5 1336 aa26.45■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 KDRP35968 1356 aa26.45■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa26.45■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 KIF16BQ96L93 1317 aa26.45■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 SYCE3A1L190 88 aa26.44■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 EFCC1Q9HA90 598 aa26.44■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 TMEM63CQ9P1W3 806 aa26.44■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 TNS3Q68CZ2 1445 aa26.43■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 CREBRFQ8IUR6 639 aa26.43■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 TMEM57Q8N5G2 664 aa26.43■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 ALS2Q96Q42 1657 aa26.43■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 ITPRIPQ8IWB1 547 aa26.42■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP26.41■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 ZNF428Q96B54 188 aa26.41■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 GCP02774 474 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP26.4■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP26.4■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 NHSL1Q5SYE7 1610 aa26.4■■□□□ 1.82
PITX1-201ENST00000265340 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.39■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 KRT24Q2M2I5 525 aa26.39■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 RNF214Q8ND24 703 aa26.39■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP26.39■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 KIF24Q5T7B8 1368 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 CLGNO14967 610 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 PSEN1P49768 467 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP26.38■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 TSPY26PQ9H489 355 aa26.38■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 UVSSAQ2YD98 709 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 DDX19BQ9UMR2 479 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 LTN1O94822 1766 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 CHL1O00533 1208 aa26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.37■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 CRB1P82279 1406 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 NFAT5O94916 1531 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP26.36■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 MBD3O95983 291 aa26.36■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 C17orf53Q8N3J3 647 aaPredicted RBP26.35■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 KCNH5Q8NCM2 988 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 HDAC5Q9UQL6 1122 aa26.35■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 KRT222Q8N1A0 295 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP26.34■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 MIS18AQ9NYP9 233 aa26.34■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP26.33■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 AK9Q5TCS8 1911 aa26.33■■□□□ 1.81
PITX1-201ENST00000265340 USHBP1Q8N6Y0 703 aa26.32■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 KIF18AQ8NI77 898 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 SLIT3O75094 1523 aa26.31■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP26.3■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 RTL1A6NKG5 1358 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 KIAA1524Q8TCG1 905 aa26.3■■□□□ 1.8
PITX1-201ENST00000265340 IP6K1Q92551 441 aa26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.5 ms