RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262539.7

PTPN3-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPN3, Length 6,832 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN3-201ENST00000262539 RAD50Q92878 1312 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 MTX1Q13505 466 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 UBR1Q8IWV7 1749 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 SURF6O75683 361 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 NBPF6Q5VWK0 638 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 NBPF4Q96M43 638 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 MYOM1P52179 1685 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 CNTROBQ8N137 903 aa9.97□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 LMTK3Q96Q04 1460 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.96□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
PTPN3-201ENST00000262539 CEP89Q96ST8 783 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 OSBPL3Q9H4L5 887 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 A0A087WZG4 1122 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 RGL2O15211 777 aa9.96□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PXDNLA1KZ92 1463 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 RLBP1P12271 317 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 EXOC5O00471 708 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 MX1P20591 662 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TMOD3Q9NYL9 352 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 KRT32Q14532 448 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SNX21Q969T3 373 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SLC52A2Q9HAB3 445 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 IL17REQ8NFR9 667 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ATP10DQ9P241 1426 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SSH3Q8TE77 659 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TBC1D32Q96NH3 1257 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 KIF13AQ9H1H9 1805 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SRGAP3O43295 1099 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF790Q6PG37 636 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 KIF6Q6ZMV9 814 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 FAM83GA6ND36 823 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 CEP85Q6P2H3 762 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PSMA5P28066 241 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ECHDC1Q9NTX5 307 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 AKAP2Q9Y2D5 859 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 CRB1P82279 1406 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PHKG2P15735 406 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 DCTN1Q14203 1278 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TSPYL6Q8N831 410 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 RGS12O14924 1447 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 AMOTL1Q8IY63 956 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PDCP20941 246 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 BRINP3Q76B58 766 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 NT5C2P49902 561 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TTC22Q5TAA0 569 aa9.92□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ANKRD1Q15327 319 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PI4KAP2A4QPH2 592 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 IGHDP01880 384 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TPM4P67936 248 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 GPR108Q9NPR9 543 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ITSN1Q15811 1721 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 CEP126Q9P2H0 1117 aa9.91□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 GRM8O00222 908 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 PLBD2Q8NHP8 589 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 ATG3Q9NT62 314 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 STAP2Q9UGK3 403 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC191Q8NCU4 936 aa9.9□□□□□ -0.82
PTPN3-201ENST00000262539 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 C8orf34Q49A92 452 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 RHPN1Q8TCX5 695 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 PARP10Q53GL7 1025 aa9.9□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 IL15P40933 162 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 NWD1Q149M9 1564 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 KIF1AQ12756 1690 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 HSPA2P54652 639 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CTNNA3Q9UI47 895 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 ADAMTSL3P82987 1691 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 CCDC34Q96HJ3 373 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 PDE1AP54750 535 aa9.89□□□□□ -0.83
PTPN3-201ENST00000262539 VPS37DQ86XT2 251 aa9.89□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms