RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628545.1

GLIS1-202, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,807 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-202ENST00000628545 GSX2Q9BZM3 304 aa17.02■□□□□ 0.32
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GLIS1-202ENST00000628545 SCN1AP35498 2009 aa17■□□□□ 0.31
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GLIS1-202ENST00000628545 STAT5BP51692 787 aa16.99■□□□□ 0.31
GLIS1-202ENST00000628545 SSTP61278 116 aa16.99■□□□□ 0.31
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