RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617451.4

PTPRF-216, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PTPRF, Length 1,129 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-216ENST00000617451 SP140Q13342 867 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 UGT3A1Q6NUS8 523 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LCTLQ6UWM7 567 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SLC5A8Q8N695 610 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MFSD9Q8NBP5 474 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PEX11GQ96HA9 241 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MAGED4Q96JG8 741 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR1F2PQ96R84 312 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LPAR4Q99677 370 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 FAM167BQ9BTA0 163 aa23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MAGEB17A8MXT2 336 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SLC16A5O15375 505 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NPPBP16860 134 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 RGS4P49798 205 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 USP10Q14694 798 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SPPL2CQ8IUH8 684 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PALM2Q8IXS6 379 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TMEM178AQ8NBL3 297 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR5T3Q8NGG3 340 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TSLPQ969D9 159 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 FRMD6Q96NE9 622 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NDNQ99608 321 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 RBCK1Q9BYM8 510 aa23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF860A6NHJ4 632 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 GABRR3A8MPY1 467 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SMSP52788 366 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 HERC3Q15034 1050 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PAQR3Q6TCH7 311 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LGI4Q8N135 537 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 RASGEF1CQ8N431 466 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NAT8LQ8N9F0 302 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ABHD11Q8NFV4 315 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LURAP1Q96LR2 239 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 HAUS8Q9BT25 410 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SARGQ9BW04 601 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TRIM8Q9BZR9 551 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R13Q9NYV9 303 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC168Q8NDH2 2452 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 F8P00451 2351 aa23.43■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA5E9PKD4 350 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NEURL1O76050 574 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SP1P08047 785 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR4D2P58180 307 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SLC26A5P58743 744 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TAS2R50P59544 299 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OC90Q02509 493 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CYP1B1Q16678 543 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PHKG1Q16816 387 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SIAH3Q8IW03 269 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MYO1HQ8N1T3 1032 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 HORMAD2Q8N7B1 307 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF740Q8NDX6 193 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR4K1Q8NGD4 311 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 TBC1D20Q96BZ9 403 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NPIPA1Q9UND3 350 aa23.42■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDK2AP1O14519 115 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 FHP07954 510 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 GABRB3P28472 473 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CCR8P51685 355 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 SLC25A25Q6KCM7 469 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CCDC137Q6PK04 289 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ELP5Q8TE02 316 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MS4A14Q96JA4 679 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDCP1Q9H5V8 836 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LRFN1Q9P244 771 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MEMO1Q9Y316 297 aa23.41■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NDC80O14777 642 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 NDUFS4O43181 175 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ASNA1O43681 348 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR1F1O43749 312 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 DNAJB6O75190 326 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 HIST1H2ADP20671 130 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDKN2DP55273 166 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PWP1Q13610 501 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 CDSNQ15517 529 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 FAM98AQ8NCA5 519 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 OR56A3Q8NH54 315 aa23.4■■□□□ 1.34
PTPRF-216ENST00000617451 LINGO1Q96FE5 620 aa23.4■■□□□ 1.34
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