RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602516.1

HCG18-244, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 2,890 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-244ENST00000602516 ACTG1P63261 375 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACTG2P63267 376 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACTC1P68032 377 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ACTA1P68133 377 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GALNT2Q10471 571 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GBX1Q14549 363 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PDZK1Q5T2W1 519 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF813Q6ZN06 617 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 USP53Q70EK8 1073 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NANOGP1Q8N7R0 232 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SYT14Q8NB59 555 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 POGLUT1Q8NBL1 392 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NETO2Q8NC67 525 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PLA2G15Q8NCC3 412 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR6X1Q8NH79 312 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CREB3L4Q8TEY5 395 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SNX33Q8WV41 574 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ISOC1Q96CN7 298 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 AP2M1Q96CW1 435 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OTUB2Q96DC9 234 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MTERF3Q96E29 417 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 LINGO1Q96FE5 620 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C10orf90Q96M02 699 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RIPOR3Q96MK2 946 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OR5M11Q96RB7 305 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MAP3K3Q99759 626 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SMOC1Q9H4F8 434 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ALG2Q9H553 416 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SAR1AQ9NR31 198 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 KLHL1Q9NR64 748 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SPASTQ9UBP0 616 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 EBF1Q9UH73 591 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PADI3Q9ULW8 664 aa7.38□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 A0A0U1RQF3 1178 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PIPSLA2A3N6 862 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CASTOR2A6NHX0 329 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SEPT4O43236 478 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FKBP6O75344 327 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZFPL1O95159 310 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IGLV3-25P01717 112 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BGNP21810 368 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 PTPN3P26045 913 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MGAT1P26572 445 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPR4P46093 362 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OMPP47874 163 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CTBSQ01459 385 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RPS6KA2Q15349 733 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SLC36A3Q495N2 470 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 KLHL12Q53G59 568 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 RUNDC3AQ59EK9 446 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ARMCX4Q5H9R4 360 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SEL1L3Q68CR1 1132 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C1orf94Q6P1W5 598 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 USP45Q70EL2 814 aa7.37□□□□□ -1.23
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HCG18-244ENST00000602516 CLNKQ7Z7G1 428 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 SLCO6A1Q86UG4 719 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMEM200AQ86VY9 491 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 NPWQ8N729 165 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CCNYQ8ND76 341 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ST7LQ8TDW4 575 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MYLPFQ96A32 169 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 C14orf144Q96I85 54 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MIPEPQ99797 713 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GPR63Q9BZJ6 419 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 BABAM2Q9NXR7 383 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MPP6Q9NZW5 540 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TMEM216Q9P0N5 145 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FKBPLQ9UIM3 349 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CA14Q9ULX7 337 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 FRMPD3Q5JV73 1810 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 H0YAE9 185 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 DFNA5O60443 496 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CNTN5O94779 1100 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 AP2A1O95782 977 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GSRP00390 522 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 F12P00748 615 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IFNA4P05014 189 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CBSLP0DN79 551 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CD247P20963 164 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 HOXA9P31269 272 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 CBSP35520 551 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 TPI1P60174 286 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ERVK-25P63136 954 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 IFITM3Q01628 133 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 GNA12Q03113 381 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 OVGP1Q12889 678 aa7.37□□□□□ -1.23
HCG18-244ENST00000602516 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
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