RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567690.5

CCNDBP1-212, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCNDBP1, Length 936 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-212ENST00000567690 PIAS1O75925 651 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 UNC5CO95185 931 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN12O95859 305 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 AHSGP02765 367 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC35G6P0C7Q6 338 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EDN3P14138 238 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2ADP20671 130 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FDXRP22570 491 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GRK3P35626 688 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNF4AP41235 474 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PER3P56645 1201 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM53BQ14153 422 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ABRAXAS2Q15018 415 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DEFB134Q4QY38 66 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SFT2D3Q587I9 215 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CATSPEREQ5SY80 951 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HECTD2Q5U5R9 776 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMEM205Q6UW68 189 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LCTLQ6UWM7 567 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ANKRD37Q7Z713 158 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LURAP1LQ8IV03 231 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 BEST3Q8N1M1 668 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CAMKVQ8NCB2 501 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 LMF1Q96S06 567 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYTH2Q99418 400 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HIST1H2AJQ99878 128 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 H2AFJQ9BTM1 129 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TUBB6Q9BUF5 446 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SGPP1Q9BX95 441 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HES7Q9BYE0 225 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RHBGQ9H310 441 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 KLHL1Q9NR64 748 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PSAT1Q9Y617 370 aa6.77□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DIDO1Q9BTC0 2240 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TRGV8A0A0C4DH27 118 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A0G2JN53 185 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 A0A1W2PQ72 361 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ARHGAP10A1A4S6 786 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 OR5H15A6NDH6 313 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 WIPF3A6NGB9 483 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 C4orf51C9J302 202 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM227AF5H4B4 570 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 H0YIG0 161 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CDC7O00311 574 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 SLC16A5O15375 505 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTI1O43156 1089 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PRAMEF2O60811 474 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 B4GALT2O60909 372 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DNAJB6O75190 326 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 WISP2O76076 250 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RASAL1O95294 804 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TTC4O95801 387 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 NPPBP16860 134 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TCP1P17987 556 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCND1P24385 295 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 HRH2P25021 359 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 IVDP26440 423 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 MST1P26927 711 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CCR8P51685 355 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TDGF1P3P51864 188 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ITGA8P53708 1063 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 IL2P60568 153 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RAB8AP61006 207 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DR1Q01658 176 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RELAQ04206 551 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 DUPD1Q68J44 220 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 FAM45BPQ6NSW5 357 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 GFRALQ6UXV0 394 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 KIAA0408Q6ZU52 694 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 TMPRSS11BQ86T26 416 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CRLF3Q8IUI8 442 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CNTN4Q8IWV2 1026 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 CYP4X1Q8N118 509 aa6.76□□□□□ -1.33
CCNDBP1-212ENST00000567690 PDIK1LQ8N165 341 aa6.76□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.1 ms