RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567306.5

PDXDC1-215, Transcript of pyridoxal dependent decarboxylase domain containing 1, humanhuman

TSL 5

Gene PDXDC1, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDXDC1-215ENST00000567306 NUDT2P50583 147 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CCT8P50990 548 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EPHA4P54764 986 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GFERP55789 205 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 OR1D5P58170 312 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SLC25A3Q00325 362 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ACSM2AQ08AH3 577 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 NR1D2Q14995 579 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MAPRE2Q15555 327 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SPIN4Q56A73 249 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CACHD1Q5VU97 1274 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 NKAIN2Q5VXU1 208 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ACSM2BQ68CK6 577 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ARMC6Q6NXE6 501 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 IRGCQ6NXR0 463 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ZC3H14Q6PJT7 736 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 FIGLAQ6QHK4 219 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RNF44Q7L0R7 432 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 UBE3DQ7Z6J8 389 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RABEPKQ7Z6M1 372 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RETREG3Q86VR2 466 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 METTL4Q8N3J2 472 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CDC26Q8NHZ8 85 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 VPS33AQ96AX1 596 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KLHL29Q96CT2 875 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 F2RL3Q96RI0 385 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SERPINI1Q99574 410 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RTKNQ9BST9 563 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TUBB6Q9BUF5 446 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ARRDC1-AS1Q9H2J1 176 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SEMA6CQ9H3T2 930 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KLHL31Q9H511 634 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CLMPQ9H6B4 373 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LHX9Q9NQ69 397 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MRGBPQ9NV56 204 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TAS2R1Q9NYW7 299 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ANKMY1Q9P2S6 941 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LRIT1Q9P2V4 623 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ADGRE2Q9UHX3 823 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PILRAQ9UKJ1 303 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SLC6A14Q9UN76 642 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SNX7Q9UNH6 387 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GON4LQ3T8J9 2241 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TDRD6O60522 2096 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.13□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CACNA1EQ15878 2313 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A0G2JN53 185 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 A0A0J9YVX5 310 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 LRIT2A6NDA9 550 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PRR33A8MZF0 331 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MRASO14807 208 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CAPN5O15484 640 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GYG2O15488 501 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 YKT6O15498 198 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 SIGLEC6O43699 453 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MYO1DO94832 1006 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 FKBP9O95302 570 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CER1O95813 267 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 B3GALT4O96024 378 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KLK1P06870 262 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CTSBP07858 339 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KRT16P08779 473 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ALPPL2P10696 532 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 NQO1P15559 274 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GLB1P16278 677 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ENGP17813 658 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GSTM2P28161 218 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ALDH4A1P30038 563 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 BSGP35613 385 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 GRK3P35626 688 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 AHRP35869 848 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 RAP1GDS1P52306 607 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DGKQP52824 942 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CLDN8P56748 225 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CORO7P57737 925 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 KCNK10P57789 538 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 MXRA7P84157 204 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 CFHR1Q03591 330 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 HKDC1Q2TB90 917 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 DEFB110Q30KQ9 67 aa7.12□□□□□ -1.27
PDXDC1-215ENST00000567306 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms