RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563952.1

CMTM4-204, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 1,023 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-204ENST00000563952 ANKRD53Q8N9V6 530 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ESAMQ96AP7 390 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ACSS3Q9H6R3 686 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 NMRAL1Q9HBL8 299 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 LUZP4Q9P127 313 aa29.1■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ECHS1P30084 290 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 XCR1P46094 333 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 KCNC4Q03721 635 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 HERC3Q15034 1050 aa29.09■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 MINDY4Q4G0A6 757 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 CDKL4Q5MAI5 379 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 STAG3L4Q8TBR4 150 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 NT5CQ8TCD5 201 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 IGSF5Q9NSI5 407 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 DNAJC11Q9NVH1 559 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 ACOT9Q9Y305 439 aa29.09■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 TTLL8A6PVC2 850 aa29.08■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 GGT5P36269 586 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 HNF4AP41235 474 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 KCNC1P48547 511 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 Q0VFX4 171 aa29.08■■■□□ 2.25
CMTM4-204ENST00000563952 DEFB134Q4QY38 66 aa29.08■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 SNX15Q9NRS6 342 aa29.08■■■□□ 2.25
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CMTM4-204ENST00000563952 HMX2A2RU54 273 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 SUPT3HB4E1H0 165 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 SUPT3HO75486 399 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 STK16O75716 305 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 B3GALT4O96024 378 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 COX6A1P12074 109 aa29.07■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 NDUFAF7Q7L592 441 aa29.07■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 TRPV3Q8NET8 790 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 KCTD4Q8WVF5 259 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 NXNL1Q96CM4 212 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 VN1R1Q9GZP7 353 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 LHPPQ9H008 270 aa29.07■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 CLMPQ9H6B4 373 aa29.07■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 CD97P48960 835 aa29.06■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 SLC6A19Q695T7 634 aa29.06■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 PDK4Q16654 411 aa29.05■■■□□ 2.24
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CMTM4-204ENST00000563952 TMEM205Q6UW68 189 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 KBTBD2Q8IY47 623 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP29.04■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 KRT78Q8N1N4 520 aa29.04■■■□□ 2.24
CMTM4-204ENST00000563952 ZADH2Q8N4Q0 377 aa29.04■■■□□ 2.24
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