RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561395.5

TPM1-231, Transcript of tropomyosin 1, human

TSL 5

Gene TPM1, Length 673 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPM1-231	ENST00000561395	LAPTM5	Q13571	262 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	FZD2	Q14332	565 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KRT33B	Q14525	404 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KIAA0040	Q15053	153 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TCEA2	Q15560	299 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MMEL1	Q495T6	779 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	COQ5	Q5HYK3	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PAGE2B	Q5JRK9	111 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MED27	Q6P2C8	311 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HACD2	Q6Y1H2	254 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RETREG3	Q86VR2	466 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	IQCH	Q86VS3	1027 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	DCP2	Q8IU60	420 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SCUBE1	Q8IWY4	988 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	LIX1	Q8N485	282 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	RNF175	Q8N4F7	328 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR7G3	Q8NG95	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	OR2L8	Q8NGY9	312 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CCL4L1	Q8NHW4	92 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	HUS1B	Q8NHY5	278 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SNIP1	Q8TAD8	396 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PROKR1	Q8TCW9	393 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	UBE2E3	Q969T4	207 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SPDL1	Q96EA4	605 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	METTL2A	Q96IZ6	378 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC45A3	Q96JT2	553 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	CLPTM1L	Q96KA5	538 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	MTERF1	Q99551	399 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	THTPA	Q9BU02	230 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ACTL8	Q9H568	366 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	KIR3DX1	Q9H7L2	352 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	WDR41	Q9HAD4	459 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLC52A3	Q9NQ40	469 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	AASDHPPT	Q9NRN7	309 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TAC3	Q9UHF0	121 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ICK	Q9UPZ9	632 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	NDUFAF1	Q9Y375	327 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TMED5	Q9Y3A6	229 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	PCDHGB2	Q9Y5G2	931 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	AK5	Q9Y6K8	562 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SLCO1B1	Q9Y6L6	691 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	SEC23IP	Q9Y6Y8	1000 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		7.22	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.25
TPM1-231	ENST00000561395	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PRAMEF33	A0A0G2JMD5	474 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PP18	115 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395		A0A1W2PR77	199 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	DYTN	A2CJ06	578 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	ASPDH	A6ND91	283 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	ANGPT2	O15123	496 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	TNFSF14	O43557	240 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	DFNA5	O60443	496 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	EED	O75530	441 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	CIB2	O75838	187 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	ETHE1	O95571	254 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PRPS2	P11908	318 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	F3	P13726	295 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PCSK2	P16519	638 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	AMD1	P17707	334 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	SDC1	P18827	310 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PSMB5	P28074	263 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	MAPK1	P28482	360 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PIK3CB	P42338	1070 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	CCR8	P51685	355 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	POLR2J	P52435	117 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	MTTP	P55157	894 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	KCNK10	P57789	538 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PSME3	P61289	254 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	REEP5	Q00765	189 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	BNC1	Q01954	994 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	RHD	Q02161	417 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	TLE3	Q04726	772 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	LY6D	Q14210	128 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PTGR1	Q14914	329 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	HIST2H2AC	Q16777	129 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	HLA-B	Q31612	363 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	TRMT5	Q32P41	509 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	VPS26B	Q4G0F5	336 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	TIGD2	Q4W5G0	525 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	ICE2	Q659A1	982 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	HIST2H2AA3	Q6FI13	130 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	NOXRED1	Q6NXP6	359 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	C8orf82	Q6P1X6	216 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		7.21	□□□□□ -1.26
TPM1-231	ENST00000561395	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.21	□□□□□ -1.26

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