RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559259.1

MFGE8-210, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

TSL 2

Gene MFGE8, Length 611 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-210ENST00000559259 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 NXNQ6DKJ4 435 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 SCIMPQ6UWF3 145 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 FAM20CQ8IXL6 584 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 OR4D9Q8NGE8 314 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 RHBDD1Q8TEB9 315 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 MAP3K3Q99759 626 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 SAR1AQ9NR31 198 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 AHSPQ9NZD4 102 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 SLC12A4Q9UP95 1085 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 SPEGQ15772 3267 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 FRYQ5TBA9 3013 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 USP24Q9UPU5 2620 aa17.34■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 TPRP12270 2363 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 PCM1Q15154 2024 aa17.33■□□□□ 0.37
MFGE8-210ENST00000559259 FEZF1A0PJY2 475 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 E9PBE3 544 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 KLHL41O60662 606 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CTSVO60911 334 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CBFA2T3O75081 653 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PEX11AO75192 247 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CSF2RBP32927 897 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 GSTM5P46439 218 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 GFERP55789 205 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HMGCS1Q01581 520 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CFHR1Q03591 330 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 C6orf89Q6UWU4 347 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ASPGQ86U10 573 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 MTDHQ86UE4 582 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 DNAJC22Q8N4W6 341 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 FNDC5Q8NAU1 212 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CAMKVQ8NCB2 501 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CHTF18Q8WVB6 975 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 KLHL6Q8WZ60 621 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 MTFMTQ96DP5 389 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SLC41A2Q96JW4 573 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PPP1R36Q96LQ0 422 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF285Q96NJ3 590 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TGM7Q96PF1 710 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HBEGFQ99075 208 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 BRINP2Q9C0B6 783 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ZNF768Q9H5H4 540 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 AIG1Q9NVV5 245 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CABIN1Q9Y6J0 2220 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 AKAP13Q12802 2813 aa17.33■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PTPRBP23467 1997 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 A0A1W2PQM1 296 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 URADA6NGE7 173 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 EBAG9O00559 213 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 FCHO1O14526 889 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ZSCAN9O15535 394 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SLC35G6P0C7Q6 338 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PRPS2P11908 318 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 MYF5P13349 255 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ACADVLP49748 655 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RGS1Q08116 209 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SQLEQ14534 574 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NKAIN2Q5VXU1 208 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ADNP2Q6IQ32 1131 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 VN1R4Q7Z5H5 301 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 CLNKQ7Z7G1 428 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 METTL4Q8N3J2 472 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 QRFPRQ96P65 431 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SLC6A16Q9GZN6 736 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 NMUR2Q9GZQ4 415 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PDE7BQ9NP56 450 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SDR39U1Q9NRG7 319 aaPredicted RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ADAM29Q9UKF5 820 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 EPG5Q9HCE0 2579 aa17.32■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ASPMQ8IZT6 3477 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 LRIT2A6NDA9 550 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 SEC22BO75396 215 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 MYO1DO94832 1006 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ETHE1O95571 254 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 PVRP15151 417 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 GABRA4P48169 554 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 EMP3P54852 163 aa17.31■□□□□ 0.36
MFGE8-210ENST00000559259 STX1BP61266 288 aa17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.9 ms