RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555381.5

ATXN3-232, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ATXN3, Length 803 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-232ENST00000555381 DNAJC22Q8N4W6 341 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 CNTD1Q8N815 330 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 DNAAF3Q8N9W5 541 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 CCNYQ8ND76 341 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 NEK11Q8NG66 645 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 OR11G2Q8NGC1 345 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 OR52E1Q8NGJ3 308 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SPATA3Q8NHX4 192 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 FAM71BQ8TC56 605 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZNF398Q8TD17 642 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PHF10Q8WUB8 498 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PSMF1Q92530 271 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 RMDN2Q96LZ7 410 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TRIM7Q9C029 511 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SLC25A51Q9H1U9 297 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SLC26A1Q9H2B4 701 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TRABDQ9H4I3 376 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MVB12BQ9H7P6 319 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 IRAK4Q9NWZ3 460 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TAB2Q9NYJ8 693 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TAS2R14Q9NYV8 317 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PTGFRNQ9P2B2 879 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TINAGQ9UJW2 476 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PLCL2Q9UPR0 1127 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TESMINQ9Y4I5 508 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SCINQ9Y6U3 715 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ANKRD36A6QL64 1941 aa4.6□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 A0A1B0GX78 115 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 UBE2QL1A1L167 161 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 VSTM2BA6NLU5 285 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 E9PLN8 166 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 KCNK1O00180 336 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 HCRTR1O43613 425 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MFSD11O43934 449 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PRAMEF2O60811 474 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ULK1O75385 1050 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 BMP10O95393 424 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 LY86O95711 162 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 WDPCPO95876 746 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 EPOP01588 193 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 LPLP06858 475 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PRR35P0CG20 571 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MYBL1P10243 752 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ICAM2P13598 275 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TCF4P15884 667 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 AKT1P31749 480 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 AP2B1P63010 937 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 IFI35P80217 286 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 FOLH1Q04609 750 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 CACNG1Q06432 222 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 LTBQ06643 244 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZIC1Q15915 447 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 HADHQ16836 314 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 FAM214AQ32MH5 1076 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 GAGE13Q4V321 117 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 BCL7AQ4VC05 210 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ATG9BQ674R7 924 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZNF449Q6P9G9 518 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 FAM151BQ6UXP7 276 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZNF662Q6ZS27 426 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 DET1Q7L5Y6 550 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TAOK1Q7L7X3 1001 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 BIVMQ86UB2 503 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MAP7D3Q8IWC1 876 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 KCTD6Q8NC69 237 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 HM13Q8TCT9 377 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 HEXDCQ8WVB3 486 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TADA1Q96BN2 335 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SDCCAG3Q96C92 435 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 DCUN1D1Q96GG9 259 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MAGED4Q96JG8 741 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 GPR137Q96N19 417 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 OR2A14Q96R47 310 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ADOQ96SZ5 270 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 VKORC1Q9BQB6 163 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZNF559Q9BR84 538 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SYT11Q9BT88 431 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 TMEM121Q9BTD3 319 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 XKR8Q9H6D3 395 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ZNF160Q9HCG1 818 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 PKDREJQ9NTG1 2253 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 SMOXQ9NWM0 555 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 ING3Q9NXR8 418 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 EURLQ9NYK6 297 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 STMN3Q9NZ72 180 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 COQ3Q9NZJ6 369 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 HACD3Q9P035 362 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 IL17CQ9P0M4 197 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 C11orf21Q9P2W6 132 aa4.59□□□□□ -1.67
ATXN3-232ENST00000555381 MYO1AQ9UBC5 1043 aa4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms