RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553948.1

TTC7B-202, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, humanhuman

TSL 5

Gene TTC7B, Length 630 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7B-202ENST00000553948 RGS1Q08116 209 aa30.49■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 CAPN12Q6ZSI9 719 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP30.49■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 PYROXD1Q8WU10 500 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 ERP44Q9BS26 406 aa30.49■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP30.49■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 OR2W5A6NFC9 320 aa30.48■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 TEKT2Q9UIF3 430 aa30.48■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 ALOX12P18054 663 aa30.47■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 SLC12A2P55011 1212 aa30.47■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 CEP97Q8IW35 865 aa30.47■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 AMER2Q8N7J2 671 aa30.47■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 NT5CQ8TCD5 201 aa30.47■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 MCMBPQ9BTE3 642 aa30.47■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP30.47■■■□□ 2.479e-6■■□□□ 11.4
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TTC7B-202ENST00000553948 OARD1Q9Y530 152 aa30.47■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 TMPRSS11BQ86T26 416 aa30.45■■■□□ 2.47
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TTC7B-202ENST00000553948 LANCL2Q9NS86 450 aa30.45■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 STMN3Q9NZ72 180 aa30.45■■■□□ 2.47
TTC7B-202ENST00000553948 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP30.44■■■□□ 2.46
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TTC7B-202ENST00000553948 SSTR1P30872 391 aa30.44■■■□□ 2.46
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TTC7B-202ENST00000553948 A8MUI8 341 aa30.43■■■□□ 2.46
TTC7B-202ENST00000553948 RAD51CO43502 376 aa30.43■■■□□ 2.46
TTC7B-202ENST00000553948 EXT1Q16394 746 aa30.43■■■□□ 2.46
TTC7B-202ENST00000553948 C4orf17Q53FE4 359 aa30.43■■■□□ 2.46
TTC7B-202ENST00000553948 ANKRD53Q8N9V6 530 aa30.43■■■□□ 2.46
TTC7B-202ENST00000553948 TBC1D20Q96BZ9 403 aa30.43■■■□□ 2.46
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