RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551936.5

CS-229, Transcript of citrate synthase, human

TSL 3

Gene CS, Length 744 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-229	ENST00000551936	NAPG	Q99747	312 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-229	ENST00000551936	TRIM31	Q9BZY9	425 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-229	ENST00000551936	CSTF2T	Q9H0L4	616 aa	Known RBP eCLIP	13.65	□□□□□ -0.22
CS-229	ENST00000551936	LANCL2	Q9NS86	450 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-229	ENST00000551936	OLAH	Q9NV23	265 aa		13.65	□□□□□ -0.22
CS-229	ENST00000551936	POLE	Q07864	2286 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	OR5H15	A6NDH6	313 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936		A8MUI8	341 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	EFCAB8	A8MWE9	144 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CDC7	O00311	574 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NDUFS4	O43181	175 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	LRRTM2	O43300	516 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	B3GALT4	O96024	378 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	UQCRH	P07919	91 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF37A	P17032	561 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	IL10	P22301	178 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SCTR	P47872	440 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MGAT5	Q09328	741 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CSHL1	Q14406	222 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	INA	Q16352	499 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	THOC6	Q86W42	341 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZC3HC1	Q86WB0	502 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	M1AP	Q8TC57	530 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ANKRD7	Q92527	254 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MAGEB10	Q96LZ2	347 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZFAT	Q9P243	1243 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SNX24	Q9Y343	169 aa		13.64	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SPTBN1	Q01082	2364 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FAM95C	A0A1B0GW59	222 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CTAGE15	A4D2H0	777 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF860	A6NHJ4	632 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FANCG	O15287	622 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SERPIND1	P05546	499 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	STS	P08842	583 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SMIM10L1	P0DMW3	83 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ALOX12	P18054	663 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SAT1	P21673	171 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	AHR	P35869	848 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PAFAH1B1	P43034	410 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RPL21	P46778	160 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TAS2R39	P59534	338 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CDKL1	Q00532	357 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	REEP5	Q00765	189 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF33B	Q06732	778 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	HYAL2	Q12891	473 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF460	Q14592	562 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FCRLB	Q6BAA4	426 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CTAGE6	Q86UF2	777 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CEP97	Q8IW35	865 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TBC1D19	Q8N5T2	526 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ANKRD53	Q8N9V6	530 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NR4A3	Q92570	626 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SMIM10	Q96HG1	83 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF354B	Q96LW1	612 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NPAS2	Q99743	824 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PELI2	Q9HAT8	420 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	KCNK13	Q9HB14	408 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SMYD2	Q9NRG4	433 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RNF14	Q9UBS8	474 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SLC22A14	Q9Y267	594 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DYRK1B	Q9Y463	629 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CROCC	Q5TZA2	2017 aa		13.63	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NPEPPSL1	A6NEC2	478 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	MAGEB17	A8MXT2	336 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CHST10	O43529	356 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PRAMEF2	O60811	474 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RASAL1	O95294	804 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	FH	P07954	510 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF888	P0CJ79	500 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	OLR1	P78380	273 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ACTN3	Q08043	901 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	RGS1	Q08116	209 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NSDHL	Q15738	373 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	EXT1	Q16394	746 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DEFB134	Q4QY38	66 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SFT2D3	Q587I9	215 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ACER2	Q5QJU3	275 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	ZNF787	Q6DD87	383 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	PAPD4	Q6PIY7	484 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	SUN3	Q8TAQ9	357 aa		13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
CS-229	ENST00000551936	TSLP	Q969D9	159 aa		13.62	□□□□□ -0.23

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