RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550283.1

RAB5B-208, Transcript of RAB5B, member RAS oncogene family, human

TSL 3

Gene RAB5B, Length 665 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAB5B-208	ENST00000550283	TSPAN8	P19075	237 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	AGXT	P21549	392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	HRH2	P25021	359 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	POLE2	P56282	527 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	RAB8A	P61006	207 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	RHD	Q02161	417 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	KLC1	Q07866	573 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	E2F2	Q14209	437 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	NAA25	Q14CX7	972 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PDK4	Q16654	411 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FAM83E	Q2M2I3	478 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	MUM1	Q2TAK8	710 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FAM214A	Q32MH5	1076 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CRTC2	Q53ET0	693 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CDKL4	Q5MAI5	379 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	BEND6	Q5SZJ8	279 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	YOD1	Q5VVQ6	348 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ATG9B	Q674R7	924 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	UBE3D	Q7Z6J8	389 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	MRGPRE	Q86SM8	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	AFAP1L2	Q8N4X5	818 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	TEX9	Q8N6V9	391 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	OR2Y1	Q8NGV0	311 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	NT5C	Q8TCD5	201 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	UTP15	Q8TED0	518 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PHF21B	Q96EK2	531 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	WDR34	Q96EX3	536 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SMIM10	Q96HG1	83 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CDK15	Q96Q40	435 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	UBL7	Q96S82	380 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	DPH2	Q9BQC3	489 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SLC6A16	Q9GZN6	736 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	DRC3	Q9H069	523 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FAM53C	Q9NYF3	392 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ZFP69B	Q9UJL9	534 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	NAALAD2	Q9Y3Q0	740 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	HS3ST3B1	Q9Y662	390 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SCN3A	Q9NY46	2000 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	MED13	Q9UHV7	2174 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283		A8MT66	165 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283		C9J4A7	227 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283		K7EPI3	171 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	E2F3	O00716	465 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	OR7A17	O14581	309 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	WFS1	O76024	890 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	KLHL18	O94889	574 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ITGB2	P05107	769 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ZGLP1	P0C6A0	271 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	GFAP	P14136	432 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CREB1	P16220	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	GNAZ	P19086	355 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FBL	P22087	321 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CNTF	P26441	200 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PIK3CG	P48736	1102 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	EMP3	P54852	163 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283		Q0VFX4	171 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CHIT1	Q13231	466 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	DSG2	Q14126	1118 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	DEFB134	Q4QY38	66 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	XKR6	Q5GH73	641 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	BORA	Q6PGQ7	559 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	TCAIM	Q8N3R3	496 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	OR52B6	Q8NGF0	335 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FKBP10	Q96AY3	582 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	C8orf44	Q96CB5	159 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	THAP11	Q96EK4	314 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SCYL1	Q96KG9	808 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SLC26A1	Q9H2B4	701 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	COPG2	Q9UBF2	871 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FETUB	Q9UGM5	382 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	ZNF225	Q9UK10	706 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	PCTP	Q9UKL6	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	IKBKG	Q9Y6K9	419 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FAM227A	F5H4B4	570 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	DLX3	O60479	287 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	GALR3	O60755	368 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	SASH3	O75995	380 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	IPO13	O94829	963 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	RECK	O95980	971 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	S100B	P04271	92 aa	Predicted RBP	10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CELA2A	P08217	269 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	AHR	P35869	848 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	FOLR3	P41439	243 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CASP2	P42575	452 aa		10.61	□□□□□ -0.71
RAB5B-208	ENST00000550283	CCR10	P46092	362 aa		10.61	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms