RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-216ENST00000549221 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-216ENST00000549221 PCNX2A6NKB5 2137 aa7.78□□□□□ -1.16
CS-216ENST00000549221 A0A0G2JN53 185 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SERTM1A2A2V5 107 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PMS2P1A4D2B8 440 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TRPC5OSA6NMA1 111 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 E9PBE3 544 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 H3BMH7 237 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FOXE1O00358 373 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NDUFS4O43181 175 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KLHL41O60662 606 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PEX11AO75192 247 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CLEC3AO75596 197 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RFPL3O75679 317 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KLHL18O94889 574 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DKK1O94907 266 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CHEK2O96017 543 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SERPIND1P05546 499 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ALDOCP09972 364 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ANKRD34CP0C6C1 535 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NELFEP18615 380 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CXCR2P25025 360 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GRK3P35626 688 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 AHRP35869 848 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PIK3CBP42338 1070 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ARFIP2P53365 341 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 VSX2P58304 361 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RAE1P78406 368 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RELAQ04206 551 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SPIDRQ14159 915 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 C16orf72Q14CZ0 275 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 KIAA0040Q15053 153 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NR6A1Q15406 480 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GPR19Q15760 415 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ST3GAL2Q16842 350 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRTGQ2VWP7 1150 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GALNTL6Q49A17 601 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RFTN2Q52LD8 501 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 C6orf136Q5SQH8 315 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRAMEF17Q5VTA0 474 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DHRS13Q6UX07 377 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRSS41Q7RTY9 318 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 GLRX5Q86SX6 157 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ASPGQ86U10 573 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 MCATQ8IVS2 390 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 D2HGDHQ8N465 521 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CHCHD4Q8N4Q1 142 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 AMER3Q8N944 861 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 WDR48Q8TAF3 677 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CCT6BQ92526 530 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 UBE2E3Q969T4 207 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TUBGCP3Q96CW5 907 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TCTN2Q96GX1 697 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF285Q96NJ3 590 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 C1orf50Q9BV19 199 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF717Q9BY31 904 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 BRF2Q9HAW0 419 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 LHX9Q9NQ69 397 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 TCF7L2Q9NQB0 619 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa7.77□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SPTBP11277 2137 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 LRIT2A6NDA9 550 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ANKDD1BA6NHY2 528 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NPIPB8E9PQR5 432 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SLC28A1O00337 649 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PLPP1O14494 284 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NDUFAB1O14561 156 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RGS14O43566 566 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DNAJB6O75190 326 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 EEDO75530 441 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 SERPINA6P08185 405 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HSD3B1P14060 373 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 PRPH2P23942 346 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HSD3B2P26439 372 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 DIO3P55073 304 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 RPL38P63173 70 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 HSD11B2P80365 405 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ZNF33BQ06732 778 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 NAA25Q14CX7 972 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 AP5B1Q2VPB7 878 aa7.76□□□□□ -1.17
CS-216ENST00000549221 ADPRMQ3LIE5 342 aa7.76□□□□□ -1.17
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