RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530120.5

CSRP1-213, Transcript of cysteine and glycine rich protein 1, human

TSL 4

Gene CSRP1, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CSRP1-213	ENST00000530120	KRT14	P02533	472 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	C8G	P07360	202 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	HSD17B3	P37058	310 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC1A2	P43004	574 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	CA7	P43166	264 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	RGS4	P49798	205 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	KRTAP10-9	P60411	292 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	SKP1	P63208	163 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	DR1	Q01658	176 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	TLE4	Q04727	773 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	EEF1A2	Q05639	463 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	PTK6	Q13882	451 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	CYP1B1	Q16678	543 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF324B	Q6AW86	544 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	NIPAL1	Q6NVV3	410 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	ZC3H7A	Q8IWR0	971 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	LRRC56	Q8IYG6	542 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	DTWD1	Q8N5C7	304 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	CATSPER1	Q8NEC5	780 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	DNAJB8	Q8NHS0	232 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	GIMAP7	Q8NHV1	300 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	CD200R1	Q8TD46	325 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	PSMF1	Q92530	271 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	MTFMT	Q96DP5	389 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	C14orf79	Q96F83	325 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	ABI3	Q9P2A4	366 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	SEC14L3	Q9UDX4	400 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	TSR3	Q9UJK0	312 aa	Known RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	MKL2	Q9ULH7	1088 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	MED16	Q9Y2X0	877 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	PCDHGB6	Q9Y5F9	930 aa		11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	NCOA6	Q14686	2063 aa	Predicted RBP	11.34	□□□□□ -0.59
CSRP1-213	ENST00000530120	HAT1	O14929	419 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC16A5	O15375	505 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	FOXS1	O43638	330 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TTC4	O95801	387 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MYZAP	P0CAP1	466 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IL10	P22301	178 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IMPA1	P29218	277 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	GRK3	P35626	688 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	FNTA	P49354	379 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	VPS41	P49754	854 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	AGTR2	P50052	363 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TBPL1	P62380	186 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PCOLCE	Q15113	449 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CEP85L	Q5SZL2	805 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	DUPD1	Q68J44	220 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PLAG1	Q6DJT9	500 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	UBE2R2	Q712K3	238 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	DENND6A	Q8IWF6	608 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PALM2	Q8IXS6	379 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CAMKV	Q8NCB2	501 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MAGOHB	Q96A72	148 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC138	Q96M89	665 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	FMO2	Q99518	471 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	GPR21	Q99679	349 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ERP44	Q9BS26	406 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	NAT9	Q9BTE0	207 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	C20orf96	Q9NUD7	363 aa	Predicted RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	GALP	Q9UBC7	116 aa		11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TRMT6	Q9UJA5	497 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	RRP15	Q9Y3B9	282 aa	Known RBP	11.33	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	OR5H15	A6NDH6	313 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PABPN1L	A6NDY0	278 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	P2RX6	O15547	441 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	MLYCD	O95822	493 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC35G6	P0C7Q6	338 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PGAM1	P18669	254 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	AGA	P20933	346 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	YBX1	P67809	324 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CTBP1	Q13363	440 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	EXT1	Q16394	746 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ANKRD22	Q5VYY1	191 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TMEM214	Q6NUQ4	689 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	ZNF549	Q6P9A3	640 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	CCDC137	Q6PK04	289 aa	Known RBP	11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	KIAA0408	Q6ZU52	694 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	GALNT7	Q86SF2	657 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	C17orf64	Q86WR6	236 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SIRT6	Q8N6T7	355 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	PPFIBP2	Q8ND30	876 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	IMMP1L	Q96LU5	166 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	OR1F2P	Q96R84	312 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	TAAR6	Q96RI8	345 aa		11.32	□□□□□ -0.6
CSRP1-213	ENST00000530120	SLC30A3	Q99726	388 aa		11.32	□□□□□ -0.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.8 ms