RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498367.1

PDCD4-211, Transcript of programmed cell death 4, humanhuman

TSL 3

Gene PDCD4, Length 975 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD4-211ENST00000498367 C4orf36Q96KX1 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PAAF1Q9BRP4 392 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CLPBQ9H078 707 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SPATC1LQ9H0A9 340 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RNF208Q9H0X6 261 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 RAD18Q9NS91 495 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 C20orf141Q9NUB4 165 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PIGVQ9NUD9 493 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 DPP3Q9NY33 737 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 USE1Q9NZ43 259 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 CTTNBP2NLQ9P2B4 639 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 UPB1Q9UBR1 384 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 HSPB7Q9UBY9 170 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 STOML2Q9UJZ1 356 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ACSL6Q9UKU0 697 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 PIGLQ9Y2B2 252 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 ZHX2Q9Y6X8 837 aa6.97□□□□□ -1.29
PDCD4-211ENST00000498367 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FBP2O00757 339 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ARPC3O15145 178 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MID1O15344 667 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 STX7O15400 261 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CYP27B1O15528 508 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 UGDHO60701 494 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NOL4O94818 638 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 OR2T7P0C7T2 308 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF28P17035 718 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TNNI1P19237 187 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 DPP4P27487 766 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 HSD11B1P28845 292 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PRDX6P30041 224 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NTF4P34130 210 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CDKN1AP38936 164 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 VIPR2P41587 438 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MAGEA6P43360 314 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 IER3P46695 156 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NPBWR1P48145 328 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FMO5P49326 533 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SELPLGQ14242 412 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SLC17A1Q14916 467 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PDK2Q15119 407 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PRAMEF7Q5VXH5 474 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MBLAC2Q68D91 279 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 DOK3Q7L591 496 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PID1Q7Z2X4 250 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SLC26A11Q86WA9 606 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 DTX1Q86Y01 620 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ARHGEF19Q8IW93 802 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 UBASH3BQ8TF42 649 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GTF2H4Q92759 462 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MAP4K1Q92918 833 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CD101Q93033 1021 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 MYDGFQ969H8 173 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SLC38A4Q969I6 547 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TOX2Q96NM4 488 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SIGLEC11Q96RL6 698 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RANBP9Q96S59 729 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GPR20Q99678 358 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CENPKQ9BS16 269 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TMEM79Q9BSE2 394 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NAT9Q9BTE0 207 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 HINT2Q9BX68 163 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SYBUQ9NX95 663 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RDH8Q9NYR8 311 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 AHSPQ9NZD4 102 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 UVRAGQ9P2Y5 699 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GINS2Q9Y248 185 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 RCE1Q9Y256 329 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 INSL6Q9Y581 213 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ABCC4O15439 1325 aa6.96□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 FAM90A27PA6NNH2 459 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 NOTOA8MTQ0 251 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 SERPINE3A8MV23 424 aa6.95□□□□□ -1.3
PDCD4-211ENST00000498367 ANKRD66B4E2M5 251 aa6.95□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms