RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495802.5

SKAP2-208, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-208	ENST00000495802		A8MVM7	634 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	TTI1	O43156	1089 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT86	O43790	486 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SCO2	O43819	266 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KIF5C	O60282	957 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ACSL4	O60488	711 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SAP30	O75446	220 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	GLCE	O94923	617 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	CLDN1	O95832	211 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	GOT1	P17174	413 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	AADAC	P22760	399 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	COPB2	P35606	906 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	OPRL1	P41146	370 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC6A12	P48065	614 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	RGS19	P49795	217 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	STX1B	P61266	288 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	HYAL1	Q12794	435 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT81	Q14533	505 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	PPA1	Q15181	289 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	TAB1	Q15750	504 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SMU1	Q2TAY7	513 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	DHRS11	Q6UWP2	260 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	TCEANC	Q8N8B7	351 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	NR4A3	Q92570	626 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ART5	Q96L15	291 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	RASL10B	Q96S79	203 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	PRMT1	Q99873	361 aa	Known RBP	4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	IL1RAPL2	Q9NP60	686 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	GPR173	Q9NS66	373 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	PFAS	O15067	1338 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		4.17	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRD1	A4D1F6	860 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC1A7	O00341	560 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF821	O75541	412 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	CRCP	O75575	148 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	RAD51D	O75771	328 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ZFAND5	O76080	213 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	NXPH2	O95156	264 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT3	P12035	628 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	HLA-F	P30511	346 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	MMP12	P39900	470 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	RPP38	P78345	283 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ARHGAP1	Q07960	439 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ABR	Q12979	859 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	DUSP5	Q16690	384 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	HLA-B	Q31612	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ARMCX4	Q5H9R4	360 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	OTUD3	Q5T2D3	398 aa	Predicted RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ADAM5	Q6NVV9	412 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802		Q6ZRP5	223 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KCTD9	Q7L273	389 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	KLHDC8A	Q8IYD2	350 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	HCAR2	Q8TDS4	363 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SAP25	Q8TEE9	199 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	DGCR6L	Q9BY27	220 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	POLK	Q9UBT6	870 aa		4.16	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		4.15	□□□□□ -1.74
SKAP2-208	ENST00000495802		A0A087WZ39	114 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C13orf42	A0A1B0GVH6	325 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802		H0YIG0	161 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP9A	O75110	1047 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MT-ND2	P03891	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SRD5A2	P31213	254 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MAGEB1	P43366	347 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MORF4L2	Q15014	288 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ODF2	Q5BJF6	829 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	LRRC38	Q5VT99	294 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	MACC1	Q6ZN28	852 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SNX32	Q86XE0	403 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	C10orf53	Q8N6V4	93 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	SMYD1	Q8NB12	490 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	AP2M1	Q96CW1	435 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	CDKN2AIPNL	Q96HQ2	116 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.15	□□□□□ -1.75
SKAP2-208	ENST00000495802	KRT12	Q99456	494 aa		4.15	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.8 ms