RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490677.1

HOXB3-211, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXB3, Length 1,109 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-211ENST00000490677 ARG2P78540 354 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 RHAGQ02094 409 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PWP1Q13610 501 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 MINDY4Q4G0A6 757 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 SLC5A11Q8WWX8 675 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 ATL1Q8WXF7 558 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 TRIM54Q9BYV2 358 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 RNF32Q9H0A6 362 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 RNF14Q9UBS8 474 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 SLC5A6Q9Y289 635 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 CACNA1DQ01668 2161 aa26.23■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF860A6NHJ4 632 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 NDUFS4O43181 175 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PIAS1O75925 651 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 CLDN1O95832 211 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 WDPCPO95876 746 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 B3GALT4O96024 378 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 ICAM2P13598 275 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 EDN3P14138 238 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 SCTRP47872 440 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 HYAL2Q12891 473 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PLAG1Q6DJT9 500 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 H3F3CQ6NXT2 135 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 NT5CQ8TCD5 201 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 METTL21AQ8WXB1 218 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 TSNARE1Q96NA8 513 aa26.22■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 A1L4Q6 167 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 DYTNA2CJ06 578 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 WFS1O76024 890 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 F10P00742 488 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PAFAH1B1P43034 410 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 TDGF1P3P51864 188 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 REEP5Q00765 189 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PLPP5Q8NEB5 264 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 PEX11GQ96HA9 241 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 AICDAQ9GZX7 198 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 RHOJQ9H4E5 214 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 ZFP69BQ9UJL9 534 aa26.21■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 MYO7BQ6PIF6 2116 aa26.2■■□□□ 1.79
HOXB3-211ENST00000490677 TRAV17A0A0B4J275 112 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C1QAP02745 245 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 CDKL1Q00532 357 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 HERC3Q15034 1050 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 MFSD4BQ5TF39 518 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ZBED8Q8IZ13 594 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 VPS39Q96JC1 886 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 OR1F2PQ96R84 312 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 NPAS2Q99743 824 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 RBCK1Q9BYM8 510 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SLC22A14Q9Y267 594 aa26.2■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf51C9J302 202 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SMIM10L1P0DMW3 83 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ALOX12P18054 663 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SAT1P21673 171 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 AHRP35869 848 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 AGTR2P50052 363 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 AP2B1P63010 937 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 CSHL1Q14406 222 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C4orf17Q53FE4 359 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 TSLPQ969D9 159 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SMIM10Q96HG1 83 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A16Q9GZN6 736 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 PELI2Q9HAT8 420 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 OARD1Q9Y530 152 aa26.19■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 CDC123O75794 336 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 IL10P22301 178 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 TSNQ15631 228 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 INAQ16352 499 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 DEFB134Q4QY38 66 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 NXPE4Q6UWF7 544 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 FAM180AQ6UWF9 173 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 BCORP1Q8N888 145 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 C5orf34Q96MH7 638 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 POPDC3Q9HBV1 291 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 GRHL1Q9NZI5 618 aa26.18■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SSTR1P30872 391 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 SLC6A12P48065 614 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 OLR1P78380 273 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ABRAXAS2Q15018 415 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 BTBD16Q32M84 506 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 CREB3L4Q8TEY5 395 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 ERP44Q9BS26 406 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 OLAHQ9NV23 265 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 WHRNQ9P202 907 aa26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP26.17■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 OR5H15A6NDH6 313 aa26.16■■□□□ 1.78
HOXB3-211ENST00000490677 MAGEB17A8MXT2 336 aa26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms