RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488196.5

STRADB-209, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 424 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-209ENST00000488196 KLHL18O94889 574 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 B3GALT4O96024 378 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 S100BP04271 92 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 INHBAP08476 426 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 TYK2P29597 1187 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 AHRP35869 848 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 GLRBP48167 497 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 KLRB1Q12918 225 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 TEX19Q8NA77 164 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PAFAH2Q99487 392 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ANAPC2Q9UJX6 822 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.11■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 J3QKU1 62 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CCNT2O60583 730 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PRAMEF4O60810 478 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 KERAO60938 352 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 BMP10O95393 424 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 HEXBP07686 556 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 FAM153BP0C7A2 387 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 HNF4AP41235 474 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 AGTR2P50052 363 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 SERPINB8P50452 374 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 EFNA3P52797 238 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 RGS1Q08116 209 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 TUBB8Q3ZCM7 444 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 FAM153CQ494X1 144 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PRAMEF9Q5VWM5 478 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ATG9BQ674R7 924 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 OR51Q1Q8NH59 317 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 NT5CQ8TCD5 201 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 NUDT4Q9NZJ9 180 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 MKL2Q9ULH7 1088 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.1■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ACPPP15309 386 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 MSH2P43246 934 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 XCR1P46094 333 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 MYBPC3Q14896 1274 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 HERC3Q15034 1050 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 FAM83EQ2M2I3 478 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 DEFB134Q4QY38 66 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CCDC91Q7Z6B0 441 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PARP9Q8IXQ6 854 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CD244Q9BZW8 370 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 EPN3Q9H201 632 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 VPS11Q9H270 941 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 KLHL31Q9H511 634 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.09■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 OR2W5A6NFC9 320 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 MAP2K7O14733 419 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CLGNO14967 610 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 DNAJB6O75190 326 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 MTHFD2P13995 350 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ALOX12P18054 663 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ITGA3P26006 1051 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CASRP41180 1078 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 HYAL2Q12891 473 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PDK4Q16654 411 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 TRPV3Q8NET8 790 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 DCAKDQ8WVC6 231 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 GPR78Q96P69 363 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 AICDAQ9GZX7 198 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 L2HGDHQ9H9P8 463 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.08■■□□□ 1.13
STRADB-209ENST00000488196 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 KLHL2O95198 593 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 EPORP19235 508 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 CXCR2P25025 360 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 SERPINB9P50453 376 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 SOX8P57073 446 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 RAB8AP61006 207 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 OLR1P78380 273 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 TLE1Q04724 770 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 Q0VFX4 171 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 NADK2Q4G0N4 442 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 XKR6Q5GH73 641 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa22.07■■□□□ 1.12
STRADB-209ENST00000488196 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.9 ms