RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486840.1

CCZ1B-211, Transcript of CCZ1 homolog B, vacuolar protein trafficking and biogenesis associated, humanhuman

TSL 2

Gene CCZ1B, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCZ1B-211ENST00000486840 FAR2Q96K12 515 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 RHOXF2Q9BQY4 288 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 VPS11Q9H270 941 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 MLXIPLQ9NP71 852 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SLAMF7Q9NQ25 335 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SNX15Q9NRS6 342 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 NFU1Q9UMS0 254 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa25.42■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A096LPK6 155 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 CCDC189A1A4V9 331 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ANKDD1BA6NHY2 528 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 TTLL8A6PVC2 850 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 KERAO60938 352 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 HPP00738 406 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 C2P06681 752 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 GSTM2P28161 218 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 GGT5P36269 586 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 HNF4AP41235 474 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 XCR1P46094 333 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 LAPTM5Q13571 262 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 XKR6Q5GH73 641 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 LAPTM4BQ86VI4 370 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 KLHDC8AQ8IYD2 350 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PDPRQ8NCN5 879 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 NT5CQ8TCD5 201 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 NXNL1Q96CM4 212 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 TRIM4Q9C037 500 aa25.41■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 A0A088AWK7 358 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 RDH16O75452 317 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 BMP10O95393 424 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 C8orf89P0DMQ9 161 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 GFAPP14136 432 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 CNTFP26441 200 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 VARSP26640 1264 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 NDUFAF7Q7L592 441 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ISCA2Q86U28 154 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 KBTBD2Q8IY47 623 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ZADH2Q8N4Q0 377 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 EFCAB3Q8N7B9 438 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 KCTD4Q8WVF5 259 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 AGAP4Q96P64 663 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 LHPPQ9H008 270 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF160Q9HCG1 818 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 OPTCQ9UBM4 332 aa25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ALOX12BO75342 701 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PDGFAP04085 211 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ICAM2P13598 275 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SOX8P57073 446 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 IRF8Q02556 426 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 KCNC4Q03721 635 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ACAP2Q15057 778 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 DEFB134Q4QY38 66 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SLC44A1Q8WWI5 657 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 C8orf44Q96CB5 159 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 SEC16BQ96JE7 1060 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 PAFAH2Q99487 392 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 EFCAB11Q9BUY7 163 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 CD244Q9BZW8 370 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 EPN3Q9H201 632 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 EHD1Q9H4M9 534 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 RIC8BQ9NVN3 520 aa25.39■■□□□ 1.66
CCZ1B-211ENST00000486840 FER1L5A0AVI2 2057 aa25.39■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 TAPBPO15533 448 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 SERPINA6P08185 405 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 CYC1P08574 325 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 JAK1P23458 1154 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 TGM3Q08188 693 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 FBXO48Q5FWF7 155 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 PRSS41Q7RTY9 318 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 RHEBL1Q8TAI7 183 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 UBE2E3Q969T4 207 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 ESAMQ96AP7 390 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 MOCOSQ96EN8 888 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 TMEM79Q9BSE2 394 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 MFRPQ9BY79 579 aa25.38■■□□□ 1.65
CCZ1B-211ENST00000486840 EPS8L2Q9H6S3 715 aa25.38■■□□□ 1.65
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