RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 ABHD13Q7L211 337 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC70Q7Z2Q7 622 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 LAPTM4BQ86VI4 370 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TEX19Q8NA77 164 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NT5CQ8TCD5 201 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 DCAKDQ8WVC6 231 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MOCOSQ96EN8 888 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TGIF2Q9GZN2 237 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP18.28■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NUP210LQ5VU65 1888 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKDD1BA6NHY2 528 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM49D1C9J1S8 452 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SOCS6O14544 535 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP2K7O14733 419 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC28A2O43868 658 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHL18O94889 574 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 GFAPP14136 432 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ALOX12P18054 663 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NR1D1P20393 614 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CSRP3P50461 194 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 IRF8Q02556 426 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 LAPTM5Q13571 262 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 XKR6Q5GH73 641 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MFSD4BQ5TF39 518 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 KIRREL2Q6UWL6 708 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD53Q8N9V6 530 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 FDCSPQ8NFU4 85 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CCT6BQ92526 530 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 SCYL1Q96KG9 808 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC77Q9BR77 488 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 EHD1Q9H4M9 534 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 NT5DC2Q9H857 520 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 GPR83Q9NYM4 423 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 HCN3Q9P1Z3 774 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 OPTCQ9UBM4 332 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXL4Q9UKA2 621 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 MKL2Q9ULH7 1088 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa18.27■□□□□ 0.52
SH3BP4-209ENST00000484097 IDSB3KWA1 339 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CEACAM4O75871 244 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 BMP10O95393 424 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 RBP1P09455 135 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 HNF4AP41235 474 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 KLRB1Q12918 225 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PAGE2BQ5JRK9 111 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 FAAH2Q6GMR7 532 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ATG14Q6ZNE5 492 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 GALNT16Q8N428 558 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 METTL21AQ8WXB1 218 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ANAPC2Q9UJX6 822 aa18.26■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SCN2AQ99250 2005 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EM74 188 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 K7EPI3 171 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PCDH17O14917 1159 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 RDH16O75452 317 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SERPINA6P08185 405 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 COL6A2P12110 1019 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ACPPP15309 386 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ITGA3P26006 1051 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 GSTM2P28161 218 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 XCR1P46094 333 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 AGTR2P50052 363 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 CHIT1Q13231 466 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 RAPSNQ13702 412 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 DOC2AQ14183 400 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC29A2Q14542 456 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PFKFB4Q16877 469 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 DEFB134Q4QY38 66 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRD1Q6QNK2 874 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 PLD6Q8N2A8 252 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 OR11G2Q8NGC1 345 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 UBTD2Q8WUN7 234 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 ISL2Q96A47 359 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 MTBPQ96DY7 904 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 EFCAB11Q9BUY7 163 aa18.25■□□□□ 0.51
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC6A16Q9GZN6 736 aa18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms