RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480301.1

ACTB-211, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 657 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-211ENST00000480301 TECRLQ5HYJ1 363 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KLC3Q6P597 504 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TIFABQ6ZNK6 161 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PRSS58Q8IYP2 241 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CREB3L4Q8TEY5 395 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 WDR34Q96EX3 536 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NT5DC2Q9H857 520 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ANKHQ9HCJ1 492 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZNF71Q9NQZ8 489 aaPredicted RBP19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa19.86■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SGK494L7N484 410 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PEX12O00623 359 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CEACAM4O75871 244 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 IGHEP01854 428 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 COL6A2P12110 1019 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RRADP55042 308 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RGS1Q08116 209 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NFATC3Q12968 1075 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 DOC2AQ14183 400 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 XKR6Q5GH73 641 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 LGSNQ5TDP6 509 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TCTN3Q6NUS6 607 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TRPV3Q8NET8 790 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP19.85■□□□□ 0.772e-10■■■■■ 70.2
ACTB-211ENST00000480301 MESP1Q9BRJ9 268 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CRB3Q9BUF7 120 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SLC6A16Q9GZN6 736 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AICDAQ9GZX7 198 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 C14orf105Q9NVL8 296 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 FETUBQ9UGM5 382 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 C3orf18Q9UK00 162 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NAALAD2Q9Y3Q0 740 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SPTA1P02549 2419 aa19.85■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 K7EPI3 171 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 AGPSO00116 658 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MASP2O00187 686 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KLHL18O94889 574 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SERPINA6P08185 405 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ALOX12P18054 663 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CD22P20273 847 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 E2F2Q14209 437 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 HERC3Q15034 1050 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SETDB1Q15047 1291 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PFKFB4Q16877 469 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 DCAF10Q5QP82 559 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KIRREL2Q6UWL6 708 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP19.84■□□□□ 0.771e-7■■□□□ 14.5
ACTB-211ENST00000480301 KRT78Q8N1N4 520 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PTCD3Q96EY7 689 aaKnown RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 KLHL31Q9H511 634 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MLXIPLQ9NP71 852 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 HCN3Q9P1Z3 774 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 OPTCQ9UBM4 332 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa19.84■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 BSNQ9UPA5 3926 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 B8ZZF3 427 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RDH16O75452 317 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 WFS1O76024 890 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 BMP10O95393 424 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 B3GALT4O96024 378 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PDGFAP04085 211 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RBP1P09455 135 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SMIM10L1P0DMW3 83 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 GFAPP14136 432 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NR1D1P20393 614 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CASP2P42575 452 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 EFNA3P52797 238 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PCDH1Q08174 1060 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 CHIT1Q13231 466 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TBCCQ15814 346 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 RBBP7Q16576 425 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 VN1R5Q7Z5H4 357 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 OR51Q1Q8NH59 317 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 MTBPQ96DY7 904 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SMIM10Q96HG1 83 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 EFCAB11Q9BUY7 163 aa19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP19.83■□□□□ 0.77
ACTB-211ENST00000480301 SCN3AQ9NY46 2000 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 LRRC14BA6NHZ5 514 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 IDSB3KWA1 339 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 C4orf51C9J302 202 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 DNAJB6O75190 326 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 JRKO75564 520 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 SLU7O95391 586 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 HNF4AP41235 474 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 EMP2P54851 167 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 VSNL1P62760 191 aa19.82■□□□□ 0.76
ACTB-211ENST00000480301 IRF8Q02556 426 aa19.82■□□□□ 0.76
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