RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 RDH16O75452 317 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 KLHL18O94889 574 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 WDR47O94967 919 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 AHRP35869 848 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GMPRP36959 345 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 XCR1P46094 333 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ATP6V0D1P61421 351 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 HERC3Q15034 1050 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CMC1Q7Z7K0 106 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 MMGT1Q8N4V1 131 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 TM9SF4Q92544 642 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 AIF1LQ9BQI0 150 aa22.39■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SERPIND1P05546 499 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 INPP5JQ15735 1006 aaPredicted RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 IGFL2Q6UWQ7 119 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GPSM1Q86YR5 675 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ZADH2Q8N4Q0 377 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 NT5CQ8TCD5 201 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM79Q9BSE2 394 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SVILO95425 2214 aa22.38■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF860A6NHJ4 632 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 TAPBPO15533 448 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SLC35E2BP0CK96 405 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 VARSP26640 1264 aaKnown RBP22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SLMAPQ14BN4 828 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PCOLCEQ15113 449 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CDKL4Q5MAI5 379 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 KBTBD2Q8IY47 623 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 EFCAB3Q8N7B9 438 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 KIAA1191Q96A73 305 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF700Q9H0M5 742 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CSAG2Q9Y5P2 127 aa22.37■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 OR2W5A6NFC9 320 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CYC1P08574 325 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 C8orf89P0DMQ9 161 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GNAZP19086 355 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GGT5P36269 586 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 RGS1Q08116 209 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 MINDY4Q4G0A6 757 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 Q6ZS92 163 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ATCAYQ86WG3 371 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 TCAIMQ8N3R3 496 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 OR5T3Q8NGG3 340 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CYTH2Q99418 400 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SLC6A16Q9GZN6 736 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 RIC8BQ9NVN3 520 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 WWOXQ9NZC7 414 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 B3GALT4O96024 378 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PRR35P0CG20 571 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ALOX12P18054 663 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 KCNC1P48547 511 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 HYAL2Q12891 473 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 DLG1Q12959 904 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CDC16Q13042 620 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 DEFB134Q4QY38 66 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO48Q5FWF7 155 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 MFSD4BQ5TF39 518 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 LANCL3Q6ZV70 420 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PSMF1Q92530 271 aa22.36■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJB6O75190 326 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SERPINA7P05543 415 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CELA2AP08217 269 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 C1GALT1C1LP0DN25 315 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CRABP2P29373 138 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ISLR2Q6UXK2 745 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 RAPH1Q70E73 1250 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 IQCKQ8N0W5 287 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 AMER2Q8N7J2 671 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PDPRQ8NCN5 879 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT11Q8NCW6 608 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 MNS1Q8NEH6 495 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 TRPV3Q8NET8 790 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CREB3L4Q8TEY5 395 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PPP4R1Q8TF05 950 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 METTL21AQ8WXB1 218 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ESAMQ96AP7 390 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 PEX11GQ96HA9 241 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ILKAPQ9H0C8 392 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 NINJ2Q9NZG7 142 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 CD274Q9NZQ7 290 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 RNF112Q9ULX5 631 aa22.35■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 POLEQ07864 2286 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 HMX2A2RU54 273 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 UQCRFS1P47985 274 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 HSPA7P48741 367 aa22.34■■□□□ 1.17
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD13Q7L211 337 aa22.34■■□□□ 1.17
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