RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445241.5

PTPA-222, Transcript of protein phosphatase 2 phosphatase activator, human

TSL 3

Gene PTPA, Length 949 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPA-222	ENST00000445241	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CHIT1	Q13231	466 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2H2	Q13888	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	DOC2A	Q14183	400 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SLBP	Q14493	270 aa	Known RBP eCLIP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RBBP5	Q15291	538 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC153	Q494R4	210 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	MLIP	Q5VWP3	458 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	GTF2H2C	Q6P1K8	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SLC22A9	Q8IVM8	553 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	PTGR2	Q8N8N7	351 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ADAMTS17	Q8TE56	1095 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CREB3L4	Q8TEY5	395 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	TTC9	Q92623	222 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	COL26A1	Q96A83	441 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ESAM	Q96AP7	390 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC126	Q96EE4	140 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	RNF31	Q96EP0	1072 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CRELD1	Q96HD1	420 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	VPS50	Q96JG6	964 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	NTMT1	Q9BV86	223 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	SPNS1	Q9H2V7	528 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	ASB1	Q9Y576	335 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PTPA-222	ENST00000445241	CCDC151	A5D8V7	595 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF4	O60810	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SBK3	P0C264	359 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR1D4	P47884	311 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	HERVK_113	P63132	956 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SLC18A2	Q05940	514 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	NKG7	Q16617	165 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ADPRM	Q3LIE5	342 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	FBXO48	Q5FWF7	155 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GRHL2	Q6ISB3	625 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	BORA	Q6PGQ7	559 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	APLF	Q8IW19	511 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SUPV3L1	Q8IYB8	786 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TEX9	Q8N6V9	391 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	AMER3	Q8N944	861 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	L3MBTL4	Q8NA19	623 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	KCT2	Q8NC54	265 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SRFBP1	Q8NEF9	429 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	RDH11	Q8TC12	318 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GAL3ST3	Q96A11	431 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	REPS1	Q96D71	796 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	RUFY1	Q96T51	708 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SPSB2	Q99619	263 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ERVK-6	Q9BXR3	956 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ADNP	Q9H2P0	1102 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SENP1	Q9P0U3	644 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TUBD1	Q9UJT1	453 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MID2	Q9UJV3	735 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PCTP	Q9UKL6	214 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	STK38L	Q9Y2H1	464 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PTRH2	Q9Y3E5	179 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PCDHGA11	Q9Y5H2	935 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		A0A088AWK7	358 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		A0A1W2PPM1	405 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		A8MT66	165 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		H0YIV9	168 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA8R	I6L899	631 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CNOT3	O75175	753 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SFTPC	P11686	197 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ALOX12	P18054	663 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CD22	P20273	847 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF10	P21506	573 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ARFIP1	P53367	373 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	RPS18	P62269	152 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PHEX	P78562	749 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IL10RA	Q13651	578 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	SLC9A5	Q14940	896 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MED27	Q6P2C8	311 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	C16orf46	Q6P387	395 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	GOLGA7	Q7Z5G4	137 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TRABD2A	Q86V40	505 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	CYP4X1	Q8N118	509 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	STT3B	Q8TCJ2	826 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	MIEF2	Q96C03	454 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PHF21B	Q96EK2	531 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	OR1F2P	Q96R84	312 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	IPPK	Q9H8X2	491 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	TMEM216	Q9P0N5	145 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PTPA-222	ENST00000445241	ZNF490	Q9ULM2	529 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms