RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 SOWAHCQ53LP3 525 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HIST2H2AA3Q6FI13 130 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 AMER3Q8N944 861 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 STT3BQ8TCJ2 826 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 UBE2E3Q969T4 207 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MIEF2Q96C03 454 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MOCOSQ96EN8 888 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC6A16Q9GZN6 736 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RHBGQ9H310 441 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CLK4Q9HAZ1 481 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKHQ9HCJ1 492 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CPSF2Q9P2I0 782 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CTSFQ9UBX1 484 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TBK1Q9UHD2 729 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 DCDC2Q9UHG0 476 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TUBD1Q9UJT1 453 aa16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CLEC3AO75596 197 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 STATHP02808 62 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ZGLP1P0C6A0 271 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM10L1P0DMW3 83 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MMP11P24347 488 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SKP1P63208 163 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM69BQ5VUD6 431 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SH2D5Q6ZV89 423 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ABHD13Q7L211 337 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MREGQ8N565 214 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TEX9Q8N6V9 391 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PTGR2Q8N8N7 351 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EXD3Q8N9H8 876 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OR9A4Q8NGU2 314 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SMIM10Q96HG1 83 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 BBC3Q96PG8 261 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SEMA3GQ9NS98 782 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 C14orf105Q9NVL8 296 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TRPC4Q9UBN4 977 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ITPR1Q14643 2758 aa15.99■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MGAQ8IWI9 3026 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ANKDD1BA6NHY2 528 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 E2F3O00716 465 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 UGDHO60701 494 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPIND1P05546 499 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SBK3P0C264 359 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PYGBP11216 843 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ALOX12P18054 663 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CD22P20273 847 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 IL10P22301 178 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HPDP32754 393 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SLCO1A2P46721 670 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 POLE2P56282 527 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HYAL2Q12891 473 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LIPJQ5W064 366 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MED25Q71SY5 747 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 UTP15Q8TED0 518 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SLC39A7Q92504 469 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 TMEM216Q9P0N5 145 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM208BQ5VWN6 2430 aa15.98■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 A0A1W2PPM1 405 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LRIT2A6NDA9 550 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GOLGA8RI6L899 631 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PEX12O00623 359 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PCDH17O14917 1159 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GALR3O60755 368 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KLHL18O94889 574 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CYC1P08574 325 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 IL1RNP18510 177 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KRT15P19012 456 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 SERPINB1P30740 379 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 OTX2P32243 289 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 HNF4AP41235 474 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 RRADP55042 308 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 KLC1Q07866 573 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2H2Q13888 395 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 VWA2Q5GFL6 755 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MED27Q6P2C8 311 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PRSS41Q7RTY9 318 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 MRGPREQ86SM8 312 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PDSS2Q86YH6 399 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 LAS2Q8IYD9 372 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 CYP4X1Q8N118 509 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 PHF21BQ96EK2 531 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 VPS50Q96JG6 964 aa15.97■□□□□ 0.15
RABGEF1-204ENST00000442563 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.2 ms