RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 HMGB4Q8WW32 186 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C9orf16Q9BUW7 83 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 REEP4Q9H6H4 257 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 WASH6PQ9NQA3 447 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TRPV5Q9NQA5 729 aa22.24■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PRR19A6NJB7 356 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 EI24O14681 340 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF23P17027 643 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 C16orf72Q14CZ0 275 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 UAP1L1Q3KQV9 507 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 GALNT10Q86SR1 603 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR52E1Q8NGJ3 308 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR1E3Q8WZA6 343 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 COQ8BQ96D53 544 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SLC47A1Q96FL8 570 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OSBPL11Q9BXB4 747 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PELI2Q9HAT8 420 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SPASTQ9UBP0 616 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 GON4LQ3T8J9 2241 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SHISA7A6NL88 538 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 DLGAP1O14490 977 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CLOCKO15516 846 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NTRK1P04629 796 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NELFEP18615 380 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 AK4P27144 223 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 FAM180BQ6P0A1 224 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RAB42Q8N4Z0 105 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 VPS37AQ8NEZ2 397 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 UGT2B28Q9BY64 529 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PCBD2Q9H0N5 130 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TPT1P8Q9HAU6 139 aa22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NDRG2Q9UN36 371 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PLPP1O14494 284 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 EML2O95834 649 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 IL3P08700 152 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TMTC4Q5T4D3 741 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CAMKMTQ7Z624 323 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SLC9B2Q86UD5 537 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR4A15Q8NGL6 344 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR2M4Q96R27 311 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NTN4Q9HB63 628 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SIRT5Q9NXA8 310 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PLOD2O00469 737 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR1F1O43749 312 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 STATHP02808 62 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 FURINP09958 794 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 GABRG2P18507 467 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CASP9P55211 416 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CCINQ13939 588 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MAP7Q14244 749 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RPE65Q16518 533 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 LRRC23Q53EV4 343 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NHSL2Q5HYW2 709 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 IYDQ6PHW0 289 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TBPL2Q6SJ96 375 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SERPINA11Q86U17 422 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CCL4L1Q8NHW4 92 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D29Q9UFV1 150 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 BTNL2Q9UIR0 455 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ICKQ9UPZ9 632 aa22.22■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 KCNK5O95279 499 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 LINGO3P0C6S8 592 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 REEP5Q00765 189 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MYBPC1Q00872 1141 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PRSS53Q2L4Q9 553 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 EOGTQ5NDL2 527 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ANXA8L1Q5VT79 327 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SPRED1Q7Z699 444 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 OR2A1Q8NGT9 310 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PPCDCQ96CD2 204 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 BMFQ96LC9 184 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 BDH2Q9BUT1 245 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RHBGQ9H310 441 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 ATP6V1HQ9UI12 483 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 MAGED1Q9Y5V3 778 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RASAL1O95294 804 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 SERPIND1P05546 499 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 RETP07949 1114 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT7P0C024 238 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 GPX2P18283 190 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 CXCR2P25025 360 aa22.2■■□□□ 1.15
FAAP20-209ENST00000428120 PKLRP30613 574 aa22.2■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.2 ms