RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 GSSP48637 474 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LIM2P55344 173 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BNC1Q01954 994 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CD300LDQ6UXZ3 194 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF130Q86XS8 419 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF547Q8IVP9 402 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ADHFE1Q8IWW8 467 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 UBQLNLQ8IYU4 475 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HCAR2Q8TDS4 363 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OVCA2Q8WZ82 227 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC10A4Q96EP9 437 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 BPIFA1Q9NP55 256 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZSCAN32Q9NX65 697 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SPATA7Q9P0W8 599 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MKLN1Q9UL63 735 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KIR3DL1P43629 444 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 HBA1P69905 142 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TPBGQ13641 420 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM71E1Q6IPT2 247 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ARMC8Q8IUR7 673 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PHC2Q8IXK0 858 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FBXO22Q8NEZ5 403 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MAL2Q969L2 176 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CMTM7Q96FZ5 175 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RAD18Q9NS91 495 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OLA1Q9NTK5 396 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CLIC1O00299 241 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PSIP1O75475 530 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SC5DO75845 299 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MYO1DO94832 1006 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LATS1O95835 1130 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CXCL10P02778 98 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MESP2Q0VG99 397 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DUSP7Q16829 419 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRG2Q64ET8 278 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRA10AC1Q70Z53 315 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 APCDD1Q8J025 514 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 STK40Q8N2I9 435 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR56A3Q8NH54 315 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM63Q969Q1 353 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SENP5Q96HI0 755 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FRG2BQ96QU4 278 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 KATNAL1Q9BW62 490 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RGS10O43665 173 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ERGP11308 486 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CKBP12277 381 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PRPS1L1P21108 318 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GATMP50440 423 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 DOC2AQ14183 400 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF235Q14590 738 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM215Q68D42 235 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LILRA6Q6PI73 481 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NAGSQ8N159 534 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PSD4Q8NDX1 1056 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF461Q8TAF7 563 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 S100ZQ8WXG8 99 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MRGPRX3Q96LB0 322 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 APOLD1Q96LR9 279 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TSNARE1Q96NA8 513 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC32A1Q9H598 525 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 NDUFB11Q9NX14 153 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TAS2R7Q9NYW3 318 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SH3BP4Q9P0V3 963 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 AP3M1Q9Y2T2 418 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 C10orf142B7Z368 130 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FPGTO14772 594 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MOSPD3O75425 235 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 E2F6O75461 281 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 OR12D1P0DN82 309 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 SLC2A4P14672 509 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 GKP32189 559 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PCGF2P35227 344 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 LSM3P62310 102 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 ASAH1Q13510 395 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CHRNA6Q15825 494 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 TRIM16LQ309B1 348 aa3.48□□□□□ -1.85
PGGT1B-203ENST00000419445 PNCKQ6P2M8 343 aa3.48□□□□□ -1.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.8 ms