RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416893.2

ATG4AP1-201, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene ATG4AP1, Length 538 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4AP1-201ENST00000416893 ENGP17813 658 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 WT1P19544 449 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CD27P26842 260 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NUDT1P36639 197 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CDKN2BP42772 138 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 MMP13P45452 471 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 KRT6CP48668 564 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CSNK1DP48730 415 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMED10P49755 219 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 RENBPP51606 427 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 LIMK1P53667 647 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 UCP3P55916 312 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 WNT3P56703 355 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 MAXP61244 160 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 AP1S1P61966 158 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 DYNLT1P63172 113 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 BNC1Q01954 994 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC10A7Q0GE19 358 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 GRIK2Q13002 908 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC13A2Q13183 592 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CTBP1Q13363 440 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 ITIH4Q14624 930 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NR1D2Q14995 579 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TAZQ16635 292 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 ZNF284Q2VY69 593 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TFDP3Q5H9I0 405 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMTC4Q5T4D3 741 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 STPG1Q5TH74 334 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SEL1L3Q68CR1 1132 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 DENND2CQ68D51 928 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 PPP4R4Q6NUP7 873 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 GDPD4Q6W3E5 623 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SNX32Q86XE0 403 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CAMK1DQ8IU85 385 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CTAGE4Q8IX94 777 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CACNA2D3Q8IZS8 1091 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 PGBD5Q8N414 524 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 LSMEM1Q8N8F7 131 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 BBOF1Q8ND07 529 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 DDHD1Q8NEL9 900 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 OR7G1Q8NGA0 311 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 STARD8Q92502 1023 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CCT6BQ92526 530 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 KLK6Q92876 244 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 PEX13Q92968 403 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 RAB7BQ96AH8 199 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 HDAC11Q96DB2 347 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SERAC1Q96JX3 654 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NSMCE3Q96MG7 304 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TSGA13Q96PP4 275 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 LGMNQ99538 433 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TIMP4Q99727 224 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SPATA16Q9BXB7 569 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NDEL1Q9GZM8 345 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 KLK15Q9H2R5 256 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TM9SF3Q9HD45 589 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 NT5MQ9NPB1 228 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TMEM9BQ9NQ34 198 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 DLL3Q9NYJ7 618 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 PTTG2Q9NZH5 202 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 XPR1Q9UBH6 696 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TBK1Q9UHD2 729 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC12A4Q9UP95 1085 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CA5BQ9Y2D0 317 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 LRCH1Q9Y2L9 728 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 HEY1Q9Y5J3 304 aa4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SEC23IPQ9Y6Y8 1000 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 A0A1W2PR77 199 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 GMNCA6NCL1 334 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 IGLON5A6NGN9 336 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 C4orf47A7E2U8 309 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SYCE1LA8MT33 242 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 E9PBE3 544 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 AGPSO00116 658 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 KCNK1O00180 336 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 AP3B1O00203 1094 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC30A4O14863 429 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SLC31A1O15431 190 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 CST8O60676 142 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 SOCS5O75159 536 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 GUCY1B2O75343 617 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 TSPAN9O75954 239 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 FTCDO95954 541 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 WNT1P04628 370 aa4.74□□□□□ -1.65
ATG4AP1-201ENST00000416893 PRKCGP05129 697 aa4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms